Protein–RNA interactions for Protein: B1AY10

Nfx1, Transcriptional repressor NF-X1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfx1B1AY10 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nfx1B1AY10 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nfx1B1AY10 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nfx1B1AY10 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nfx1B1AY10 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nfx1B1AY10 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Nfx1B1AY10 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nfx1B1AY10 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Nfx1B1AY10 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nfx1B1AY10 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nfx1B1AY10 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nfx1B1AY10 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nfx1B1AY10 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nfx1B1AY10 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nfx1B1AY10 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nfx1B1AY10 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nfx1B1AY10 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nfx1B1AY10 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nfx1B1AY10 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nfx1B1AY10 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nfx1B1AY10 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nfx1B1AY10 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nfx1B1AY10 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nfx1B1AY10 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nfx1B1AY10 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nfx1B1AY10 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nfx1B1AY10 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nfx1B1AY10 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nfx1B1AY10 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nfx1B1AY10 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Nfx1B1AY10 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nfx1B1AY10 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nfx1B1AY10 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nfx1B1AY10 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nfx1B1AY10 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nfx1B1AY10 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Nfx1B1AY10 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nfx1B1AY10 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nfx1B1AY10 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nfx1B1AY10 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Nfx1B1AY10 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Nfx1B1AY10 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nfx1B1AY10 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Nfx1B1AY10 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Nfx1B1AY10 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nfx1B1AY10 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nfx1B1AY10 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nfx1B1AY10 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nfx1B1AY10 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nfx1B1AY10 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nfx1B1AY10 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nfx1B1AY10 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nfx1B1AY10 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nfx1B1AY10 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Nfx1B1AY10 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Nfx1B1AY10 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nfx1B1AY10 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nfx1B1AY10 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nfx1B1AY10 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nfx1B1AY10 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nfx1B1AY10 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nfx1B1AY10 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nfx1B1AY10 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nfx1B1AY10 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nfx1B1AY10 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nfx1B1AY10 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Nfx1B1AY10 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Nfx1B1AY10 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Nfx1B1AY10 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nfx1B1AY10 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nfx1B1AY10 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nfx1B1AY10 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Nfx1B1AY10 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Nfx1B1AY10 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nfx1B1AY10 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nfx1B1AY10 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nfx1B1AY10 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nfx1B1AY10 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nfx1B1AY10 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nfx1B1AY10 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nfx1B1AY10 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nfx1B1AY10 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nfx1B1AY10 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nfx1B1AY10 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nfx1B1AY10 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nfx1B1AY10 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nfx1B1AY10 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nfx1B1AY10 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nfx1B1AY10 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nfx1B1AY10 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nfx1B1AY10 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nfx1B1AY10 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nfx1B1AY10 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nfx1B1AY10 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nfx1B1AY10 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nfx1B1AY10 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nfx1B1AY10 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nfx1B1AY10 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Nfx1B1AY10 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nfx1B1AY10 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms