Protein–RNA interactions for Protein: B1AVK5

Col4a6, Collagen, type IV, alpha 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a6B1AVK5 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col4a6B1AVK5 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Col4a6B1AVK5 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col4a6B1AVK5 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Col4a6B1AVK5 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col4a6B1AVK5 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col4a6B1AVK5 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col4a6B1AVK5 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col4a6B1AVK5 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col4a6B1AVK5 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col4a6B1AVK5 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col4a6B1AVK5 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Col4a6B1AVK5 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col4a6B1AVK5 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col4a6B1AVK5 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col4a6B1AVK5 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Col4a6B1AVK5 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col4a6B1AVK5 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col4a6B1AVK5 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col4a6B1AVK5 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col4a6B1AVK5 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col4a6B1AVK5 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col4a6B1AVK5 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col4a6B1AVK5 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col4a6B1AVK5 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col4a6B1AVK5 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Col4a6B1AVK5 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Col4a6B1AVK5 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col4a6B1AVK5 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Col4a6B1AVK5 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col4a6B1AVK5 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Col4a6B1AVK5 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col4a6B1AVK5 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col4a6B1AVK5 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col4a6B1AVK5 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col4a6B1AVK5 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col4a6B1AVK5 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col4a6B1AVK5 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Col4a6B1AVK5 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col4a6B1AVK5 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col4a6B1AVK5 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col4a6B1AVK5 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col4a6B1AVK5 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Col4a6B1AVK5 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col4a6B1AVK5 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Col4a6B1AVK5 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col4a6B1AVK5 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col4a6B1AVK5 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Col4a6B1AVK5 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col4a6B1AVK5 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col4a6B1AVK5 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Col4a6B1AVK5 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
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Col4a6B1AVK5 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col4a6B1AVK5 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Col4a6B1AVK5 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col4a6B1AVK5 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col4a6B1AVK5 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col4a6B1AVK5 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col4a6B1AVK5 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col4a6B1AVK5 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col4a6B1AVK5 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col4a6B1AVK5 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Col4a6B1AVK5 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col4a6B1AVK5 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col4a6B1AVK5 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Col4a6B1AVK5 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col4a6B1AVK5 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col4a6B1AVK5 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Col4a6B1AVK5 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Col4a6B1AVK5 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col4a6B1AVK5 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col4a6B1AVK5 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col4a6B1AVK5 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col4a6B1AVK5 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col4a6B1AVK5 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col4a6B1AVK5 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col4a6B1AVK5 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col4a6B1AVK5 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col4a6B1AVK5 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col4a6B1AVK5 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col4a6B1AVK5 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col4a6B1AVK5 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col4a6B1AVK5 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col4a6B1AVK5 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col4a6B1AVK5 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col4a6B1AVK5 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Col4a6B1AVK5 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
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