Protein–RNA interactions for Protein: B1ARD8

Slfn8, Schlafen 8, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn8B1ARD8 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slfn8B1ARD8 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slfn8B1ARD8 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Slfn8B1ARD8 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slfn8B1ARD8 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slfn8B1ARD8 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slfn8B1ARD8 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slfn8B1ARD8 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Slfn8B1ARD8 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slfn8B1ARD8 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slfn8B1ARD8 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Slfn8B1ARD8 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slfn8B1ARD8 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Slfn8B1ARD8 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slfn8B1ARD8 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Slfn8B1ARD8 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slfn8B1ARD8 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Slfn8B1ARD8 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slfn8B1ARD8 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Slfn8B1ARD8 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slfn8B1ARD8 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slfn8B1ARD8 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Slfn8B1ARD8 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slfn8B1ARD8 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slfn8B1ARD8 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Slfn8B1ARD8 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Slfn8B1ARD8 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Slfn8B1ARD8 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Slfn8B1ARD8 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Slfn8B1ARD8 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Slfn8B1ARD8 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Slfn8B1ARD8 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Slfn8B1ARD8 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Slfn8B1ARD8 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Slfn8B1ARD8 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Slfn8B1ARD8 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Slfn8B1ARD8 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Slfn8B1ARD8 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Slfn8B1ARD8 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Slfn8B1ARD8 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Slfn8B1ARD8 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Slfn8B1ARD8 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Slfn8B1ARD8 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Slfn8B1ARD8 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Slfn8B1ARD8 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Slfn8B1ARD8 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Slfn8B1ARD8 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Slfn8B1ARD8 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Slfn8B1ARD8 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Slfn8B1ARD8 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Slfn8B1ARD8 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Slfn8B1ARD8 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Slfn8B1ARD8 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Slfn8B1ARD8 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Slfn8B1ARD8 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Slfn8B1ARD8 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Slfn8B1ARD8 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Slfn8B1ARD8 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Slfn8B1ARD8 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Slfn8B1ARD8 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Slfn8B1ARD8 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Slfn8B1ARD8 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Slfn8B1ARD8 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Slfn8B1ARD8 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Slfn8B1ARD8 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Slfn8B1ARD8 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Slfn8B1ARD8 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Slfn8B1ARD8 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Slfn8B1ARD8 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Slfn8B1ARD8 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Slfn8B1ARD8 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Slfn8B1ARD8 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Slfn8B1ARD8 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Slfn8B1ARD8 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Slfn8B1ARD8 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Slfn8B1ARD8 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Slfn8B1ARD8 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Slfn8B1ARD8 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Slfn8B1ARD8 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Slfn8B1ARD8 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Slfn8B1ARD8 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Slfn8B1ARD8 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Slfn8B1ARD8 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Slfn8B1ARD8 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Slfn8B1ARD8 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Slfn8B1ARD8 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Slfn8B1ARD8 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Slfn8B1ARD8 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Slfn8B1ARD8 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Slfn8B1ARD8 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Slfn8B1ARD8 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Slfn8B1ARD8 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Slfn8B1ARD8 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Slfn8B1ARD8 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Slfn8B1ARD8 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Slfn8B1ARD8 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Slfn8B1ARD8 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Slfn8B1ARD8 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Slfn8B1ARD8 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Slfn8B1ARD8 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms