Protein–RNA interactions for Protein: A4UUI3

Gbp4, Guanylate binding protein 4.1, mousemouse

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Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp4A4UUI3 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gbp4A4UUI3 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gbp4A4UUI3 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gbp4A4UUI3 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gbp4A4UUI3 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gbp4A4UUI3 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gbp4A4UUI3 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gbp4A4UUI3 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gbp4A4UUI3 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gbp4A4UUI3 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gbp4A4UUI3 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gbp4A4UUI3 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gbp4A4UUI3 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gbp4A4UUI3 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gbp4A4UUI3 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gbp4A4UUI3 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gbp4A4UUI3 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gbp4A4UUI3 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gbp4A4UUI3 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gbp4A4UUI3 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gbp4A4UUI3 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gbp4A4UUI3 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gbp4A4UUI3 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gbp4A4UUI3 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gbp4A4UUI3 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gbp4A4UUI3 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gbp4A4UUI3 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gbp4A4UUI3 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gbp4A4UUI3 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gbp4A4UUI3 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gbp4A4UUI3 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gbp4A4UUI3 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gbp4A4UUI3 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gbp4A4UUI3 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gbp4A4UUI3 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gbp4A4UUI3 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gbp4A4UUI3 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gbp4A4UUI3 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gbp4A4UUI3 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gbp4A4UUI3 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gbp4A4UUI3 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gbp4A4UUI3 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gbp4A4UUI3 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gbp4A4UUI3 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gbp4A4UUI3 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gbp4A4UUI3 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gbp4A4UUI3 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gbp4A4UUI3 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gbp4A4UUI3 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gbp4A4UUI3 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gbp4A4UUI3 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gbp4A4UUI3 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gbp4A4UUI3 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gbp4A4UUI3 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gbp4A4UUI3 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gbp4A4UUI3 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gbp4A4UUI3 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gbp4A4UUI3 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gbp4A4UUI3 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gbp4A4UUI3 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gbp4A4UUI3 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gbp4A4UUI3 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gbp4A4UUI3 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gbp4A4UUI3 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gbp4A4UUI3 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gbp4A4UUI3 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gbp4A4UUI3 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gbp4A4UUI3 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gbp4A4UUI3 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gbp4A4UUI3 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gbp4A4UUI3 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gbp4A4UUI3 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gbp4A4UUI3 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gbp4A4UUI3 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gbp4A4UUI3 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gbp4A4UUI3 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gbp4A4UUI3 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gbp4A4UUI3 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gbp4A4UUI3 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gbp4A4UUI3 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gbp4A4UUI3 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gbp4A4UUI3 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gbp4A4UUI3 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gbp4A4UUI3 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gbp4A4UUI3 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gbp4A4UUI3 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gbp4A4UUI3 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gbp4A4UUI3 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gbp4A4UUI3 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gbp4A4UUI3 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gbp4A4UUI3 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gbp4A4UUI3 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gbp4A4UUI3 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gbp4A4UUI3 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gbp4A4UUI3 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gbp4A4UUI3 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gbp4A4UUI3 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gbp4A4UUI3 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gbp4A4UUI3 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gbp4A4UUI3 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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