Protein–RNA interactions for Protein: A3KGV1

Odf2, Outer dense fiber protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 830 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2A3KGV1 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Odf2A3KGV1 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Odf2A3KGV1 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Odf2A3KGV1 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Odf2A3KGV1 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Odf2A3KGV1 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Odf2A3KGV1 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Odf2A3KGV1 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Odf2A3KGV1 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Odf2A3KGV1 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Odf2A3KGV1 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Odf2A3KGV1 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Odf2A3KGV1 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Odf2A3KGV1 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Odf2A3KGV1 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Odf2A3KGV1 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Odf2A3KGV1 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Odf2A3KGV1 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Odf2A3KGV1 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Odf2A3KGV1 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Odf2A3KGV1 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Odf2A3KGV1 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Odf2A3KGV1 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Odf2A3KGV1 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Odf2A3KGV1 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Odf2A3KGV1 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Odf2A3KGV1 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Odf2A3KGV1 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Odf2A3KGV1 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Odf2A3KGV1 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Odf2A3KGV1 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Odf2A3KGV1 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Odf2A3KGV1 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Odf2A3KGV1 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Odf2A3KGV1 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Odf2A3KGV1 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Odf2A3KGV1 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Odf2A3KGV1 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Odf2A3KGV1 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Odf2A3KGV1 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Odf2A3KGV1 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Odf2A3KGV1 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Odf2A3KGV1 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Odf2A3KGV1 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Odf2A3KGV1 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Odf2A3KGV1 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Odf2A3KGV1 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Odf2A3KGV1 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Odf2A3KGV1 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Odf2A3KGV1 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Odf2A3KGV1 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Odf2A3KGV1 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Odf2A3KGV1 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Odf2A3KGV1 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Odf2A3KGV1 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Odf2A3KGV1 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Odf2A3KGV1 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Odf2A3KGV1 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Odf2A3KGV1 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Odf2A3KGV1 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Odf2A3KGV1 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Odf2A3KGV1 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Odf2A3KGV1 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Odf2A3KGV1 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Odf2A3KGV1 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Odf2A3KGV1 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Odf2A3KGV1 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Odf2A3KGV1 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Odf2A3KGV1 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Odf2A3KGV1 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Odf2A3KGV1 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Odf2A3KGV1 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Odf2A3KGV1 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Odf2A3KGV1 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Odf2A3KGV1 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Odf2A3KGV1 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Odf2A3KGV1 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Odf2A3KGV1 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Odf2A3KGV1 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Odf2A3KGV1 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Odf2A3KGV1 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Odf2A3KGV1 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Odf2A3KGV1 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Odf2A3KGV1 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Odf2A3KGV1 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Odf2A3KGV1 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Odf2A3KGV1 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Odf2A3KGV1 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Odf2A3KGV1 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Odf2A3KGV1 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Odf2A3KGV1 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Odf2A3KGV1 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Odf2A3KGV1 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Odf2A3KGV1 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Odf2A3KGV1 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Odf2A3KGV1 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Odf2A3KGV1 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Odf2A3KGV1 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Odf2A3KGV1 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Odf2A3KGV1 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms