Protein–RNA interactions for Protein: A3KG45

Gm6880, MCG1035527 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6880A3KG45 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm6880A3KG45 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm6880A3KG45 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm6880A3KG45 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm6880A3KG45 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm6880A3KG45 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm6880A3KG45 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm6880A3KG45 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm6880A3KG45 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm6880A3KG45 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm6880A3KG45 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm6880A3KG45 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm6880A3KG45 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm6880A3KG45 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm6880A3KG45 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm6880A3KG45 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm6880A3KG45 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm6880A3KG45 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm6880A3KG45 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm6880A3KG45 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm6880A3KG45 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm6880A3KG45 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm6880A3KG45 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm6880A3KG45 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm6880A3KG45 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm6880A3KG45 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm6880A3KG45 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm6880A3KG45 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm6880A3KG45 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm6880A3KG45 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm6880A3KG45 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm6880A3KG45 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm6880A3KG45 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm6880A3KG45 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm6880A3KG45 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm6880A3KG45 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm6880A3KG45 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm6880A3KG45 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm6880A3KG45 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm6880A3KG45 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm6880A3KG45 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm6880A3KG45 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm6880A3KG45 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm6880A3KG45 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm6880A3KG45 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm6880A3KG45 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm6880A3KG45 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm6880A3KG45 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm6880A3KG45 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm6880A3KG45 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm6880A3KG45 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm6880A3KG45 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm6880A3KG45 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm6880A3KG45 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm6880A3KG45 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm6880A3KG45 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm6880A3KG45 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm6880A3KG45 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm6880A3KG45 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm6880A3KG45 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm6880A3KG45 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm6880A3KG45 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm6880A3KG45 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm6880A3KG45 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm6880A3KG45 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm6880A3KG45 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm6880A3KG45 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm6880A3KG45 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm6880A3KG45 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm6880A3KG45 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm6880A3KG45 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm6880A3KG45 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm6880A3KG45 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm6880A3KG45 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm6880A3KG45 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm6880A3KG45 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm6880A3KG45 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm6880A3KG45 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm6880A3KG45 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm6880A3KG45 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm6880A3KG45 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm6880A3KG45 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm6880A3KG45 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm6880A3KG45 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm6880A3KG45 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm6880A3KG45 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm6880A3KG45 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm6880A3KG45 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm6880A3KG45 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm6880A3KG45 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm6880A3KG45 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm6880A3KG45 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm6880A3KG45 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm6880A3KG45 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm6880A3KG45 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm6880A3KG45 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm6880A3KG45 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm6880A3KG45 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm6880A3KG45 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm6880A3KG45 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms