Protein–RNA interactions for Protein: A2ARP9

Catsper2, Cation channel sperm-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Catsper2A2ARP9 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Catsper2A2ARP9 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
Catsper2A2ARP9 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Catsper2A2ARP9 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Catsper2A2ARP9 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Catsper2A2ARP9 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Catsper2A2ARP9 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Catsper2A2ARP9 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Catsper2A2ARP9 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Catsper2A2ARP9 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Catsper2A2ARP9 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Catsper2A2ARP9 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Catsper2A2ARP9 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Catsper2A2ARP9 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Catsper2A2ARP9 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Catsper2A2ARP9 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Catsper2A2ARP9 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Catsper2A2ARP9 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Catsper2A2ARP9 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Catsper2A2ARP9 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Catsper2A2ARP9 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Catsper2A2ARP9 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Catsper2A2ARP9 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Catsper2A2ARP9 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Catsper2A2ARP9 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Catsper2A2ARP9 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Catsper2A2ARP9 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Catsper2A2ARP9 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Catsper2A2ARP9 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Catsper2A2ARP9 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Catsper2A2ARP9 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Catsper2A2ARP9 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Catsper2A2ARP9 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Catsper2A2ARP9 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Catsper2A2ARP9 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Catsper2A2ARP9 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Catsper2A2ARP9 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Catsper2A2ARP9 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Catsper2A2ARP9 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Catsper2A2ARP9 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Catsper2A2ARP9 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Catsper2A2ARP9 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Catsper2A2ARP9 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Catsper2A2ARP9 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Catsper2A2ARP9 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Catsper2A2ARP9 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Catsper2A2ARP9 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Catsper2A2ARP9 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Catsper2A2ARP9 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Catsper2A2ARP9 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Catsper2A2ARP9 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Catsper2A2ARP9 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Catsper2A2ARP9 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Catsper2A2ARP9 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Catsper2A2ARP9 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Catsper2A2ARP9 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Catsper2A2ARP9 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Catsper2A2ARP9 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Catsper2A2ARP9 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Catsper2A2ARP9 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Catsper2A2ARP9 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Catsper2A2ARP9 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Catsper2A2ARP9 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Catsper2A2ARP9 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Catsper2A2ARP9 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Catsper2A2ARP9 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Catsper2A2ARP9 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Catsper2A2ARP9 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Catsper2A2ARP9 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Catsper2A2ARP9 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Catsper2A2ARP9 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Catsper2A2ARP9 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Catsper2A2ARP9 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Catsper2A2ARP9 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Catsper2A2ARP9 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Catsper2A2ARP9 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Catsper2A2ARP9 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Catsper2A2ARP9 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Catsper2A2ARP9 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Catsper2A2ARP9 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Catsper2A2ARP9 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Catsper2A2ARP9 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Catsper2A2ARP9 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Catsper2A2ARP9 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Catsper2A2ARP9 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Catsper2A2ARP9 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Catsper2A2ARP9 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Catsper2A2ARP9 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Catsper2A2ARP9 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Catsper2A2ARP9 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Catsper2A2ARP9 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Catsper2A2ARP9 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Catsper2A2ARP9 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Catsper2A2ARP9 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Catsper2A2ARP9 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Catsper2A2ARP9 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Catsper2A2ARP9 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Catsper2A2ARP9 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Catsper2A2ARP9 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Catsper2A2ARP9 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms