Protein–RNA interactions for Protein: A2ARM1

Patl2, Protein PAT1 homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Patl2A2ARM1 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Patl2A2ARM1 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Patl2A2ARM1 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Patl2A2ARM1 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Patl2A2ARM1 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Patl2A2ARM1 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Patl2A2ARM1 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Patl2A2ARM1 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Patl2A2ARM1 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Patl2A2ARM1 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Patl2A2ARM1 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Patl2A2ARM1 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Patl2A2ARM1 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Patl2A2ARM1 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Patl2A2ARM1 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Patl2A2ARM1 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Patl2A2ARM1 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Patl2A2ARM1 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Patl2A2ARM1 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Patl2A2ARM1 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Patl2A2ARM1 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Patl2A2ARM1 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Patl2A2ARM1 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Patl2A2ARM1 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Patl2A2ARM1 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Patl2A2ARM1 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Patl2A2ARM1 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Patl2A2ARM1 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Patl2A2ARM1 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Patl2A2ARM1 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Patl2A2ARM1 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Patl2A2ARM1 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Patl2A2ARM1 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Patl2A2ARM1 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Patl2A2ARM1 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Patl2A2ARM1 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Patl2A2ARM1 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Patl2A2ARM1 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Patl2A2ARM1 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Patl2A2ARM1 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Patl2A2ARM1 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Patl2A2ARM1 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Patl2A2ARM1 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Patl2A2ARM1 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Patl2A2ARM1 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Patl2A2ARM1 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Patl2A2ARM1 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Patl2A2ARM1 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Patl2A2ARM1 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Patl2A2ARM1 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Patl2A2ARM1 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Patl2A2ARM1 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Patl2A2ARM1 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Patl2A2ARM1 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Patl2A2ARM1 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Patl2A2ARM1 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Patl2A2ARM1 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Patl2A2ARM1 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Patl2A2ARM1 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Patl2A2ARM1 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Patl2A2ARM1 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Patl2A2ARM1 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Patl2A2ARM1 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Patl2A2ARM1 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Patl2A2ARM1 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Patl2A2ARM1 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Patl2A2ARM1 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Patl2A2ARM1 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Patl2A2ARM1 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Patl2A2ARM1 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Patl2A2ARM1 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Patl2A2ARM1 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Patl2A2ARM1 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Patl2A2ARM1 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Patl2A2ARM1 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Patl2A2ARM1 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Patl2A2ARM1 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Patl2A2ARM1 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Patl2A2ARM1 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Patl2A2ARM1 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Patl2A2ARM1 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Patl2A2ARM1 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Patl2A2ARM1 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Patl2A2ARM1 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Patl2A2ARM1 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Patl2A2ARM1 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Patl2A2ARM1 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Patl2A2ARM1 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Patl2A2ARM1 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Patl2A2ARM1 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Patl2A2ARM1 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Patl2A2ARM1 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Patl2A2ARM1 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Patl2A2ARM1 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Patl2A2ARM1 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Patl2A2ARM1 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Patl2A2ARM1 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Patl2A2ARM1 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Patl2A2ARM1 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Patl2A2ARM1 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms