Protein–RNA interactions for Protein: A2AJ77

Prdm12, PR domain zinc finger protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm12A2AJ77 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prdm12A2AJ77 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prdm12A2AJ77 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Prdm12A2AJ77 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Prdm12A2AJ77 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Prdm12A2AJ77 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prdm12A2AJ77 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prdm12A2AJ77 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prdm12A2AJ77 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prdm12A2AJ77 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prdm12A2AJ77 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prdm12A2AJ77 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prdm12A2AJ77 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prdm12A2AJ77 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Prdm12A2AJ77 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Prdm12A2AJ77 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prdm12A2AJ77 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prdm12A2AJ77 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prdm12A2AJ77 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Prdm12A2AJ77 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Prdm12A2AJ77 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prdm12A2AJ77 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prdm12A2AJ77 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prdm12A2AJ77 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prdm12A2AJ77 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prdm12A2AJ77 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prdm12A2AJ77 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prdm12A2AJ77 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prdm12A2AJ77 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Prdm12A2AJ77 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prdm12A2AJ77 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prdm12A2AJ77 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prdm12A2AJ77 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prdm12A2AJ77 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prdm12A2AJ77 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prdm12A2AJ77 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prdm12A2AJ77 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prdm12A2AJ77 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prdm12A2AJ77 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prdm12A2AJ77 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prdm12A2AJ77 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prdm12A2AJ77 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prdm12A2AJ77 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prdm12A2AJ77 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prdm12A2AJ77 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prdm12A2AJ77 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prdm12A2AJ77 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prdm12A2AJ77 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prdm12A2AJ77 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prdm12A2AJ77 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Prdm12A2AJ77 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Prdm12A2AJ77 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prdm12A2AJ77 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prdm12A2AJ77 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prdm12A2AJ77 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prdm12A2AJ77 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prdm12A2AJ77 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prdm12A2AJ77 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prdm12A2AJ77 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prdm12A2AJ77 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prdm12A2AJ77 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prdm12A2AJ77 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prdm12A2AJ77 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prdm12A2AJ77 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prdm12A2AJ77 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prdm12A2AJ77 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prdm12A2AJ77 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prdm12A2AJ77 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prdm12A2AJ77 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prdm12A2AJ77 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prdm12A2AJ77 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prdm12A2AJ77 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prdm12A2AJ77 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Prdm12A2AJ77 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prdm12A2AJ77 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prdm12A2AJ77 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prdm12A2AJ77 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prdm12A2AJ77 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prdm12A2AJ77 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prdm12A2AJ77 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prdm12A2AJ77 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prdm12A2AJ77 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Prdm12A2AJ77 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prdm12A2AJ77 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prdm12A2AJ77 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prdm12A2AJ77 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prdm12A2AJ77 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prdm12A2AJ77 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prdm12A2AJ77 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prdm12A2AJ77 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prdm12A2AJ77 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prdm12A2AJ77 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prdm12A2AJ77 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prdm12A2AJ77 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prdm12A2AJ77 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Prdm12A2AJ77 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Prdm12A2AJ77 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Prdm12A2AJ77 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Prdm12A2AJ77 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Prdm12A2AJ77 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms