Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR3

Frmpd4, FERM and PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd4A2AFR3 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Frmpd4A2AFR3 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Frmpd4A2AFR3 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Frmpd4A2AFR3 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Frmpd4A2AFR3 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Frmpd4A2AFR3 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Frmpd4A2AFR3 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Frmpd4A2AFR3 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Frmpd4A2AFR3 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Frmpd4A2AFR3 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Frmpd4A2AFR3 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Frmpd4A2AFR3 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Frmpd4A2AFR3 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Frmpd4A2AFR3 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Frmpd4A2AFR3 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Frmpd4A2AFR3 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Frmpd4A2AFR3 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Frmpd4A2AFR3 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Frmpd4A2AFR3 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Frmpd4A2AFR3 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Frmpd4A2AFR3 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Frmpd4A2AFR3 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Frmpd4A2AFR3 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Frmpd4A2AFR3 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Frmpd4A2AFR3 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Frmpd4A2AFR3 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Frmpd4A2AFR3 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Frmpd4A2AFR3 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Frmpd4A2AFR3 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Frmpd4A2AFR3 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Frmpd4A2AFR3 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Frmpd4A2AFR3 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Frmpd4A2AFR3 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Frmpd4A2AFR3 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Frmpd4A2AFR3 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Frmpd4A2AFR3 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Frmpd4A2AFR3 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Frmpd4A2AFR3 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Frmpd4A2AFR3 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Frmpd4A2AFR3 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Frmpd4A2AFR3 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Frmpd4A2AFR3 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Frmpd4A2AFR3 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Frmpd4A2AFR3 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Frmpd4A2AFR3 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Frmpd4A2AFR3 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Frmpd4A2AFR3 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Frmpd4A2AFR3 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Frmpd4A2AFR3 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Frmpd4A2AFR3 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Frmpd4A2AFR3 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Frmpd4A2AFR3 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Frmpd4A2AFR3 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Frmpd4A2AFR3 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Frmpd4A2AFR3 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Frmpd4A2AFR3 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Frmpd4A2AFR3 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Frmpd4A2AFR3 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Frmpd4A2AFR3 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Frmpd4A2AFR3 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Frmpd4A2AFR3 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Frmpd4A2AFR3 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Frmpd4A2AFR3 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Frmpd4A2AFR3 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Frmpd4A2AFR3 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Frmpd4A2AFR3 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Frmpd4A2AFR3 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Frmpd4A2AFR3 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Frmpd4A2AFR3 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Frmpd4A2AFR3 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Frmpd4A2AFR3 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Frmpd4A2AFR3 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Frmpd4A2AFR3 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Frmpd4A2AFR3 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Frmpd4A2AFR3 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Frmpd4A2AFR3 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Frmpd4A2AFR3 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Frmpd4A2AFR3 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Frmpd4A2AFR3 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Frmpd4A2AFR3 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Frmpd4A2AFR3 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Frmpd4A2AFR3 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Frmpd4A2AFR3 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Frmpd4A2AFR3 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Frmpd4A2AFR3 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Frmpd4A2AFR3 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Frmpd4A2AFR3 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Frmpd4A2AFR3 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Frmpd4A2AFR3 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Frmpd4A2AFR3 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Frmpd4A2AFR3 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Frmpd4A2AFR3 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Frmpd4A2AFR3 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Frmpd4A2AFR3 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Frmpd4A2AFR3 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Frmpd4A2AFR3 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Frmpd4A2AFR3 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Frmpd4A2AFR3 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Frmpd4A2AFR3 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Frmpd4A2AFR3 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms