Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L5

Ptprf, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, mousemouse

Predictions only

Length 1,898 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprfA2A8L5 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PtprfA2A8L5 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PtprfA2A8L5 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PtprfA2A8L5 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PtprfA2A8L5 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PtprfA2A8L5 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PtprfA2A8L5 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PtprfA2A8L5 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PtprfA2A8L5 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PtprfA2A8L5 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PtprfA2A8L5 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PtprfA2A8L5 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PtprfA2A8L5 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PtprfA2A8L5 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PtprfA2A8L5 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PtprfA2A8L5 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PtprfA2A8L5 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PtprfA2A8L5 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PtprfA2A8L5 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PtprfA2A8L5 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PtprfA2A8L5 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PtprfA2A8L5 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PtprfA2A8L5 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PtprfA2A8L5 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PtprfA2A8L5 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PtprfA2A8L5 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PtprfA2A8L5 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PtprfA2A8L5 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PtprfA2A8L5 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PtprfA2A8L5 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PtprfA2A8L5 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PtprfA2A8L5 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PtprfA2A8L5 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PtprfA2A8L5 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PtprfA2A8L5 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PtprfA2A8L5 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PtprfA2A8L5 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PtprfA2A8L5 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PtprfA2A8L5 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PtprfA2A8L5 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PtprfA2A8L5 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PtprfA2A8L5 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PtprfA2A8L5 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PtprfA2A8L5 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PtprfA2A8L5 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PtprfA2A8L5 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PtprfA2A8L5 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PtprfA2A8L5 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PtprfA2A8L5 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PtprfA2A8L5 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PtprfA2A8L5 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PtprfA2A8L5 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PtprfA2A8L5 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PtprfA2A8L5 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PtprfA2A8L5 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PtprfA2A8L5 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PtprfA2A8L5 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PtprfA2A8L5 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PtprfA2A8L5 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PtprfA2A8L5 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PtprfA2A8L5 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PtprfA2A8L5 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PtprfA2A8L5 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PtprfA2A8L5 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PtprfA2A8L5 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PtprfA2A8L5 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PtprfA2A8L5 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PtprfA2A8L5 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PtprfA2A8L5 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PtprfA2A8L5 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PtprfA2A8L5 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PtprfA2A8L5 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PtprfA2A8L5 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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PtprfA2A8L5 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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PtprfA2A8L5 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PtprfA2A8L5 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PtprfA2A8L5 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PtprfA2A8L5 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PtprfA2A8L5 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PtprfA2A8L5 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PtprfA2A8L5 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PtprfA2A8L5 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PtprfA2A8L5 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PtprfA2A8L5 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PtprfA2A8L5 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PtprfA2A8L5 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PtprfA2A8L5 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PtprfA2A8L5 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PtprfA2A8L5 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PtprfA2A8L5 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PtprfA2A8L5 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PtprfA2A8L5 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PtprfA2A8L5 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PtprfA2A8L5 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PtprfA2A8L5 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PtprfA2A8L5 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PtprfA2A8L5 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.3 ms