Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GSB3

Gm3880, Predicted pseudogene 3880, mousemouse

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Length 72 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3880A0A1B0GSB3 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Gm3880A0A1B0GSB3 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Gm3880A0A1B0GSB3 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Gm3880A0A1B0GSB3 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Gm3880A0A1B0GSB3 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Gm3880A0A1B0GSB3 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Gm3880A0A1B0GSB3 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Gm3880A0A1B0GSB3 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Gm3880A0A1B0GSB3 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Gm3880A0A1B0GSB3 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Gm3880A0A1B0GSB3 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Gm3880A0A1B0GSB3 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Gm3880A0A1B0GSB3 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Gm3880A0A1B0GSB3 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Gm3880A0A1B0GSB3 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Gm3880A0A1B0GSB3 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Gm3880A0A1B0GSB3 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Gm3880A0A1B0GSB3 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Gm3880A0A1B0GSB3 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Gm3880A0A1B0GSB3 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Gm3880A0A1B0GSB3 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Gm3880A0A1B0GSB3 Rims1-203ENSMUST00000097809 6179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Gm3880A0A1B0GSB3 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Gm3880A0A1B0GSB3 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Gm3880A0A1B0GSB3 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Gm3880A0A1B0GSB3 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Gm3880A0A1B0GSB3 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Gm3880A0A1B0GSB3 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Gm3880A0A1B0GSB3 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Gm3880A0A1B0GSB3 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Gm3880A0A1B0GSB3 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Gm3880A0A1B0GSB3 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Gm3880A0A1B0GSB3 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Gm3880A0A1B0GSB3 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Gm3880A0A1B0GSB3 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Gm3880A0A1B0GSB3 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Gm3880A0A1B0GSB3 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Gm3880A0A1B0GSB3 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Gm3880A0A1B0GSB3 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Gm3880A0A1B0GSB3 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Gm3880A0A1B0GSB3 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Gm3880A0A1B0GSB3 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Gm3880A0A1B0GSB3 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Gm3880A0A1B0GSB3 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Gm3880A0A1B0GSB3 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Gm3880A0A1B0GSB3 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Gm3880A0A1B0GSB3 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Gm3880A0A1B0GSB3 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Gm3880A0A1B0GSB3 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Gm3880A0A1B0GSB3 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Gm3880A0A1B0GSB3 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Gm3880A0A1B0GSB3 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Gm3880A0A1B0GSB3 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Gm3880A0A1B0GSB3 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Gm3880A0A1B0GSB3 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Gm3880A0A1B0GSB3 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Gm3880A0A1B0GSB3 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Gm3880A0A1B0GSB3 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Gm3880A0A1B0GSB3 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Gm3880A0A1B0GSB3 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Gm3880A0A1B0GSB3 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Gm3880A0A1B0GSB3 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Gm3880A0A1B0GSB3 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Gm3880A0A1B0GSB3 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Gm3880A0A1B0GSB3 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Gm3880A0A1B0GSB3 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Gm3880A0A1B0GSB3 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Gm3880A0A1B0GSB3 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Gm3880A0A1B0GSB3 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Gm3880A0A1B0GSB3 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Gm3880A0A1B0GSB3 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Gm3880A0A1B0GSB3 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Gm3880A0A1B0GSB3 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Gm3880A0A1B0GSB3 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Gm3880A0A1B0GSB3 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Gm3880A0A1B0GSB3 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Gm3880A0A1B0GSB3 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Gm3880A0A1B0GSB3 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Gm3880A0A1B0GSB3 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Gm3880A0A1B0GSB3 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Gm3880A0A1B0GSB3 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Gm3880A0A1B0GSB3 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Gm3880A0A1B0GSB3 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Gm3880A0A1B0GSB3 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Gm3880A0A1B0GSB3 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Gm3880A0A1B0GSB3 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Gm3880A0A1B0GSB3 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Gm3880A0A1B0GSB3 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Gm3880A0A1B0GSB3 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Gm3880A0A1B0GSB3 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
Gm3880A0A1B0GSB3 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
Gm3880A0A1B0GSB3 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.28
Gm3880A0A1B0GSB3 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.28
Gm3880A0A1B0GSB3 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
Gm3880A0A1B0GSB3 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
Gm3880A0A1B0GSB3 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.28
Gm3880A0A1B0GSB3 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
Gm3880A0A1B0GSB3 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
Gm3880A0A1B0GSB3 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.28
Gm3880A0A1B0GSB3 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
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