Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.48□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC8.47□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.47□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC8.47□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC8.46□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC8.46□□□□□ -1.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC8.46□□□□□ -1.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms