Protein–RNA interactions for Protein: W8DXL4

Lrit3, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 681 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit3W8DXL4 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lrit3W8DXL4 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lrit3W8DXL4 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lrit3W8DXL4 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lrit3W8DXL4 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lrit3W8DXL4 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lrit3W8DXL4 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrit3W8DXL4 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrit3W8DXL4 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrit3W8DXL4 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrit3W8DXL4 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrit3W8DXL4 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrit3W8DXL4 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrit3W8DXL4 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrit3W8DXL4 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrit3W8DXL4 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrit3W8DXL4 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrit3W8DXL4 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrit3W8DXL4 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrit3W8DXL4 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrit3W8DXL4 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrit3W8DXL4 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrit3W8DXL4 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrit3W8DXL4 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrit3W8DXL4 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrit3W8DXL4 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrit3W8DXL4 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrit3W8DXL4 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrit3W8DXL4 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrit3W8DXL4 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrit3W8DXL4 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrit3W8DXL4 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrit3W8DXL4 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrit3W8DXL4 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrit3W8DXL4 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrit3W8DXL4 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrit3W8DXL4 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrit3W8DXL4 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrit3W8DXL4 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrit3W8DXL4 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrit3W8DXL4 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrit3W8DXL4 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrit3W8DXL4 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrit3W8DXL4 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrit3W8DXL4 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrit3W8DXL4 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrit3W8DXL4 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrit3W8DXL4 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrit3W8DXL4 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrit3W8DXL4 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrit3W8DXL4 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrit3W8DXL4 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrit3W8DXL4 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrit3W8DXL4 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrit3W8DXL4 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrit3W8DXL4 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrit3W8DXL4 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrit3W8DXL4 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrit3W8DXL4 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrit3W8DXL4 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrit3W8DXL4 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrit3W8DXL4 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrit3W8DXL4 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrit3W8DXL4 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrit3W8DXL4 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrit3W8DXL4 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrit3W8DXL4 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrit3W8DXL4 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrit3W8DXL4 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrit3W8DXL4 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrit3W8DXL4 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrit3W8DXL4 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrit3W8DXL4 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrit3W8DXL4 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrit3W8DXL4 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrit3W8DXL4 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrit3W8DXL4 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrit3W8DXL4 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrit3W8DXL4 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrit3W8DXL4 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrit3W8DXL4 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrit3W8DXL4 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrit3W8DXL4 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrit3W8DXL4 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrit3W8DXL4 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrit3W8DXL4 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrit3W8DXL4 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrit3W8DXL4 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrit3W8DXL4 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrit3W8DXL4 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrit3W8DXL4 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrit3W8DXL4 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrit3W8DXL4 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrit3W8DXL4 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrit3W8DXL4 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrit3W8DXL4 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrit3W8DXL4 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrit3W8DXL4 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrit3W8DXL4 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrit3W8DXL4 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms