Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q2

Knop1, Lysine-rich nucleolar protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knop1Q9Z2Q2 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Knop1Q9Z2Q2 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Knop1Q9Z2Q2 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Knop1Q9Z2Q2 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Knop1Q9Z2Q2 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Knop1Q9Z2Q2 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Knop1Q9Z2Q2 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Knop1Q9Z2Q2 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Knop1Q9Z2Q2 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Knop1Q9Z2Q2 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Knop1Q9Z2Q2 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Knop1Q9Z2Q2 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Knop1Q9Z2Q2 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Knop1Q9Z2Q2 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Knop1Q9Z2Q2 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Knop1Q9Z2Q2 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Knop1Q9Z2Q2 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Knop1Q9Z2Q2 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Knop1Q9Z2Q2 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Knop1Q9Z2Q2 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Knop1Q9Z2Q2 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Knop1Q9Z2Q2 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Knop1Q9Z2Q2 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Knop1Q9Z2Q2 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Knop1Q9Z2Q2 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Knop1Q9Z2Q2 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Knop1Q9Z2Q2 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Knop1Q9Z2Q2 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Knop1Q9Z2Q2 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Knop1Q9Z2Q2 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Knop1Q9Z2Q2 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Knop1Q9Z2Q2 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Knop1Q9Z2Q2 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Knop1Q9Z2Q2 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Knop1Q9Z2Q2 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Knop1Q9Z2Q2 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Knop1Q9Z2Q2 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Knop1Q9Z2Q2 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Knop1Q9Z2Q2 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Knop1Q9Z2Q2 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Knop1Q9Z2Q2 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Knop1Q9Z2Q2 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Knop1Q9Z2Q2 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Knop1Q9Z2Q2 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Knop1Q9Z2Q2 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Knop1Q9Z2Q2 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Knop1Q9Z2Q2 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Knop1Q9Z2Q2 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Knop1Q9Z2Q2 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Knop1Q9Z2Q2 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Knop1Q9Z2Q2 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Knop1Q9Z2Q2 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Knop1Q9Z2Q2 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Knop1Q9Z2Q2 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Knop1Q9Z2Q2 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Knop1Q9Z2Q2 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Knop1Q9Z2Q2 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Knop1Q9Z2Q2 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Knop1Q9Z2Q2 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Knop1Q9Z2Q2 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Knop1Q9Z2Q2 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Knop1Q9Z2Q2 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Knop1Q9Z2Q2 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Knop1Q9Z2Q2 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Knop1Q9Z2Q2 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Knop1Q9Z2Q2 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Knop1Q9Z2Q2 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Knop1Q9Z2Q2 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Knop1Q9Z2Q2 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Knop1Q9Z2Q2 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Knop1Q9Z2Q2 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Knop1Q9Z2Q2 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Knop1Q9Z2Q2 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Knop1Q9Z2Q2 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Knop1Q9Z2Q2 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Knop1Q9Z2Q2 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Knop1Q9Z2Q2 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Knop1Q9Z2Q2 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Knop1Q9Z2Q2 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Knop1Q9Z2Q2 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Knop1Q9Z2Q2 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Knop1Q9Z2Q2 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Knop1Q9Z2Q2 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Knop1Q9Z2Q2 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Knop1Q9Z2Q2 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Knop1Q9Z2Q2 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Knop1Q9Z2Q2 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Knop1Q9Z2Q2 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Knop1Q9Z2Q2 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Knop1Q9Z2Q2 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Knop1Q9Z2Q2 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Knop1Q9Z2Q2 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Knop1Q9Z2Q2 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Knop1Q9Z2Q2 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Knop1Q9Z2Q2 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Knop1Q9Z2Q2 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Knop1Q9Z2Q2 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Knop1Q9Z2Q2 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Knop1Q9Z2Q2 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Knop1Q9Z2Q2 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms