Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2P8

Vamp5, Vesicle-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp5Q9Z2P8 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vamp5Q9Z2P8 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vamp5Q9Z2P8 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vamp5Q9Z2P8 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vamp5Q9Z2P8 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vamp5Q9Z2P8 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vamp5Q9Z2P8 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vamp5Q9Z2P8 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vamp5Q9Z2P8 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vamp5Q9Z2P8 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vamp5Q9Z2P8 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vamp5Q9Z2P8 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vamp5Q9Z2P8 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vamp5Q9Z2P8 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vamp5Q9Z2P8 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vamp5Q9Z2P8 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vamp5Q9Z2P8 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vamp5Q9Z2P8 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vamp5Q9Z2P8 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vamp5Q9Z2P8 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vamp5Q9Z2P8 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vamp5Q9Z2P8 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vamp5Q9Z2P8 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vamp5Q9Z2P8 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vamp5Q9Z2P8 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vamp5Q9Z2P8 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vamp5Q9Z2P8 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vamp5Q9Z2P8 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Vamp5Q9Z2P8 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Vamp5Q9Z2P8 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vamp5Q9Z2P8 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vamp5Q9Z2P8 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vamp5Q9Z2P8 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vamp5Q9Z2P8 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vamp5Q9Z2P8 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Vamp5Q9Z2P8 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Vamp5Q9Z2P8 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vamp5Q9Z2P8 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vamp5Q9Z2P8 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vamp5Q9Z2P8 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vamp5Q9Z2P8 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vamp5Q9Z2P8 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vamp5Q9Z2P8 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vamp5Q9Z2P8 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vamp5Q9Z2P8 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vamp5Q9Z2P8 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vamp5Q9Z2P8 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vamp5Q9Z2P8 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vamp5Q9Z2P8 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vamp5Q9Z2P8 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vamp5Q9Z2P8 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vamp5Q9Z2P8 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vamp5Q9Z2P8 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vamp5Q9Z2P8 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vamp5Q9Z2P8 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vamp5Q9Z2P8 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vamp5Q9Z2P8 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vamp5Q9Z2P8 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vamp5Q9Z2P8 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vamp5Q9Z2P8 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vamp5Q9Z2P8 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vamp5Q9Z2P8 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vamp5Q9Z2P8 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vamp5Q9Z2P8 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vamp5Q9Z2P8 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vamp5Q9Z2P8 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vamp5Q9Z2P8 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vamp5Q9Z2P8 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vamp5Q9Z2P8 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vamp5Q9Z2P8 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vamp5Q9Z2P8 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vamp5Q9Z2P8 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vamp5Q9Z2P8 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vamp5Q9Z2P8 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vamp5Q9Z2P8 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vamp5Q9Z2P8 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vamp5Q9Z2P8 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vamp5Q9Z2P8 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vamp5Q9Z2P8 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vamp5Q9Z2P8 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vamp5Q9Z2P8 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vamp5Q9Z2P8 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vamp5Q9Z2P8 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vamp5Q9Z2P8 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vamp5Q9Z2P8 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vamp5Q9Z2P8 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vamp5Q9Z2P8 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vamp5Q9Z2P8 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vamp5Q9Z2P8 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vamp5Q9Z2P8 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vamp5Q9Z2P8 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vamp5Q9Z2P8 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vamp5Q9Z2P8 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vamp5Q9Z2P8 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vamp5Q9Z2P8 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vamp5Q9Z2P8 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vamp5Q9Z2P8 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Vamp5Q9Z2P8 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vamp5Q9Z2P8 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vamp5Q9Z2P8 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms