Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2L7

Crlf3, Cytokine receptor-like factor 3, mousemouse

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Length 442 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crlf3Q9Z2L7 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Crlf3Q9Z2L7 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Crlf3Q9Z2L7 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Crlf3Q9Z2L7 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Crlf3Q9Z2L7 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Crlf3Q9Z2L7 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Crlf3Q9Z2L7 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Crlf3Q9Z2L7 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Crlf3Q9Z2L7 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Crlf3Q9Z2L7 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Crlf3Q9Z2L7 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Crlf3Q9Z2L7 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Crlf3Q9Z2L7 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Crlf3Q9Z2L7 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Crlf3Q9Z2L7 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Crlf3Q9Z2L7 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Crlf3Q9Z2L7 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Crlf3Q9Z2L7 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Crlf3Q9Z2L7 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Crlf3Q9Z2L7 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Crlf3Q9Z2L7 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Crlf3Q9Z2L7 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Crlf3Q9Z2L7 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Crlf3Q9Z2L7 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Crlf3Q9Z2L7 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Crlf3Q9Z2L7 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Crlf3Q9Z2L7 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Crlf3Q9Z2L7 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Crlf3Q9Z2L7 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Crlf3Q9Z2L7 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Crlf3Q9Z2L7 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Crlf3Q9Z2L7 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Crlf3Q9Z2L7 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Crlf3Q9Z2L7 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Crlf3Q9Z2L7 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Crlf3Q9Z2L7 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Crlf3Q9Z2L7 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Crlf3Q9Z2L7 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Crlf3Q9Z2L7 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Crlf3Q9Z2L7 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Crlf3Q9Z2L7 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Crlf3Q9Z2L7 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Crlf3Q9Z2L7 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Crlf3Q9Z2L7 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Crlf3Q9Z2L7 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Crlf3Q9Z2L7 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Crlf3Q9Z2L7 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
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Crlf3Q9Z2L7 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Crlf3Q9Z2L7 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Crlf3Q9Z2L7 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Crlf3Q9Z2L7 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Crlf3Q9Z2L7 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Crlf3Q9Z2L7 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Crlf3Q9Z2L7 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Crlf3Q9Z2L7 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Crlf3Q9Z2L7 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Crlf3Q9Z2L7 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Crlf3Q9Z2L7 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Crlf3Q9Z2L7 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Crlf3Q9Z2L7 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Crlf3Q9Z2L7 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Crlf3Q9Z2L7 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Crlf3Q9Z2L7 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Crlf3Q9Z2L7 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Crlf3Q9Z2L7 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Crlf3Q9Z2L7 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Crlf3Q9Z2L7 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Crlf3Q9Z2L7 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Crlf3Q9Z2L7 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Crlf3Q9Z2L7 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Crlf3Q9Z2L7 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Crlf3Q9Z2L7 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Crlf3Q9Z2L7 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Crlf3Q9Z2L7 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Crlf3Q9Z2L7 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Crlf3Q9Z2L7 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Crlf3Q9Z2L7 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Crlf3Q9Z2L7 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Crlf3Q9Z2L7 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Crlf3Q9Z2L7 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Crlf3Q9Z2L7 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Crlf3Q9Z2L7 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Crlf3Q9Z2L7 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Crlf3Q9Z2L7 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Crlf3Q9Z2L7 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Crlf3Q9Z2L7 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Crlf3Q9Z2L7 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Crlf3Q9Z2L7 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Crlf3Q9Z2L7 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Crlf3Q9Z2L7 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Crlf3Q9Z2L7 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Crlf3Q9Z2L7 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Crlf3Q9Z2L7 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Crlf3Q9Z2L7 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Crlf3Q9Z2L7 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Crlf3Q9Z2L7 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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