Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Z0

Uso1, General vesicular transport factor p115, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 959 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uso1Q9Z1Z0 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Uso1Q9Z1Z0 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Uso1Q9Z1Z0 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Uso1Q9Z1Z0 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Uso1Q9Z1Z0 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Uso1Q9Z1Z0 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Uso1Q9Z1Z0 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Uso1Q9Z1Z0 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Uso1Q9Z1Z0 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Uso1Q9Z1Z0 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Uso1Q9Z1Z0 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Uso1Q9Z1Z0 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Uso1Q9Z1Z0 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Uso1Q9Z1Z0 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Uso1Q9Z1Z0 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Uso1Q9Z1Z0 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Uso1Q9Z1Z0 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Uso1Q9Z1Z0 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Uso1Q9Z1Z0 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Uso1Q9Z1Z0 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Uso1Q9Z1Z0 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Uso1Q9Z1Z0 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Uso1Q9Z1Z0 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Uso1Q9Z1Z0 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Uso1Q9Z1Z0 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Uso1Q9Z1Z0 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Uso1Q9Z1Z0 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Uso1Q9Z1Z0 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Uso1Q9Z1Z0 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Uso1Q9Z1Z0 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Uso1Q9Z1Z0 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Uso1Q9Z1Z0 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Uso1Q9Z1Z0 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Uso1Q9Z1Z0 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Uso1Q9Z1Z0 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Uso1Q9Z1Z0 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Uso1Q9Z1Z0 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Uso1Q9Z1Z0 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Uso1Q9Z1Z0 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Uso1Q9Z1Z0 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Uso1Q9Z1Z0 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Uso1Q9Z1Z0 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Uso1Q9Z1Z0 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Uso1Q9Z1Z0 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Uso1Q9Z1Z0 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Uso1Q9Z1Z0 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Uso1Q9Z1Z0 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Uso1Q9Z1Z0 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Uso1Q9Z1Z0 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Uso1Q9Z1Z0 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Uso1Q9Z1Z0 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Uso1Q9Z1Z0 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Uso1Q9Z1Z0 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Uso1Q9Z1Z0 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Uso1Q9Z1Z0 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Uso1Q9Z1Z0 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Uso1Q9Z1Z0 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Uso1Q9Z1Z0 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Uso1Q9Z1Z0 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Uso1Q9Z1Z0 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Uso1Q9Z1Z0 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Uso1Q9Z1Z0 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Uso1Q9Z1Z0 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Uso1Q9Z1Z0 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Uso1Q9Z1Z0 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Uso1Q9Z1Z0 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Uso1Q9Z1Z0 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Uso1Q9Z1Z0 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Uso1Q9Z1Z0 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Uso1Q9Z1Z0 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Uso1Q9Z1Z0 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Uso1Q9Z1Z0 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Uso1Q9Z1Z0 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Uso1Q9Z1Z0 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Uso1Q9Z1Z0 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Uso1Q9Z1Z0 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Uso1Q9Z1Z0 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Uso1Q9Z1Z0 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Uso1Q9Z1Z0 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Uso1Q9Z1Z0 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Uso1Q9Z1Z0 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Uso1Q9Z1Z0 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Uso1Q9Z1Z0 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Uso1Q9Z1Z0 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Uso1Q9Z1Z0 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Uso1Q9Z1Z0 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Uso1Q9Z1Z0 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Uso1Q9Z1Z0 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Uso1Q9Z1Z0 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Uso1Q9Z1Z0 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Uso1Q9Z1Z0 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Uso1Q9Z1Z0 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Uso1Q9Z1Z0 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Uso1Q9Z1Z0 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Uso1Q9Z1Z0 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Uso1Q9Z1Z0 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Uso1Q9Z1Z0 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Uso1Q9Z1Z0 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Uso1Q9Z1Z0 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Uso1Q9Z1Z0 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.9 ms