Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1T1

Ap3b1, AP-3 complex subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3b1Q9Z1T1 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ap3b1Q9Z1T1 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ap3b1Q9Z1T1 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ap3b1Q9Z1T1 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ap3b1Q9Z1T1 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ap3b1Q9Z1T1 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ap3b1Q9Z1T1 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ap3b1Q9Z1T1 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ap3b1Q9Z1T1 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ap3b1Q9Z1T1 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ap3b1Q9Z1T1 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ap3b1Q9Z1T1 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ap3b1Q9Z1T1 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ap3b1Q9Z1T1 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ap3b1Q9Z1T1 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ap3b1Q9Z1T1 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ap3b1Q9Z1T1 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ap3b1Q9Z1T1 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ap3b1Q9Z1T1 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ap3b1Q9Z1T1 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ap3b1Q9Z1T1 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ap3b1Q9Z1T1 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Ap3b1Q9Z1T1 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Ap3b1Q9Z1T1 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Ap3b1Q9Z1T1 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ap3b1Q9Z1T1 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Ap3b1Q9Z1T1 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ap3b1Q9Z1T1 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ap3b1Q9Z1T1 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Ap3b1Q9Z1T1 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ap3b1Q9Z1T1 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ap3b1Q9Z1T1 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ap3b1Q9Z1T1 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Ap3b1Q9Z1T1 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ap3b1Q9Z1T1 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ap3b1Q9Z1T1 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ap3b1Q9Z1T1 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ap3b1Q9Z1T1 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Ap3b1Q9Z1T1 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ap3b1Q9Z1T1 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ap3b1Q9Z1T1 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ap3b1Q9Z1T1 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ap3b1Q9Z1T1 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ap3b1Q9Z1T1 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ap3b1Q9Z1T1 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ap3b1Q9Z1T1 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ap3b1Q9Z1T1 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ap3b1Q9Z1T1 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ap3b1Q9Z1T1 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ap3b1Q9Z1T1 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ap3b1Q9Z1T1 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ap3b1Q9Z1T1 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ap3b1Q9Z1T1 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ap3b1Q9Z1T1 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ap3b1Q9Z1T1 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ap3b1Q9Z1T1 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ap3b1Q9Z1T1 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ap3b1Q9Z1T1 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ap3b1Q9Z1T1 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ap3b1Q9Z1T1 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ap3b1Q9Z1T1 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ap3b1Q9Z1T1 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ap3b1Q9Z1T1 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Ap3b1Q9Z1T1 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ap3b1Q9Z1T1 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ap3b1Q9Z1T1 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ap3b1Q9Z1T1 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ap3b1Q9Z1T1 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ap3b1Q9Z1T1 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ap3b1Q9Z1T1 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ap3b1Q9Z1T1 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ap3b1Q9Z1T1 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ap3b1Q9Z1T1 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ap3b1Q9Z1T1 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ap3b1Q9Z1T1 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ap3b1Q9Z1T1 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ap3b1Q9Z1T1 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ap3b1Q9Z1T1 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ap3b1Q9Z1T1 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ap3b1Q9Z1T1 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ap3b1Q9Z1T1 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ap3b1Q9Z1T1 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ap3b1Q9Z1T1 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Ap3b1Q9Z1T1 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ap3b1Q9Z1T1 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ap3b1Q9Z1T1 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Ap3b1Q9Z1T1 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ap3b1Q9Z1T1 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ap3b1Q9Z1T1 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ap3b1Q9Z1T1 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ap3b1Q9Z1T1 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ap3b1Q9Z1T1 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ap3b1Q9Z1T1 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ap3b1Q9Z1T1 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ap3b1Q9Z1T1 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ap3b1Q9Z1T1 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ap3b1Q9Z1T1 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ap3b1Q9Z1T1 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ap3b1Q9Z1T1 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ap3b1Q9Z1T1 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.8 ms