Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1L5

Cacna2d3, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna2d3Q9Z1L5 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cacna2d3Q9Z1L5 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cacna2d3Q9Z1L5 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cacna2d3Q9Z1L5 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cacna2d3Q9Z1L5 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cacna2d3Q9Z1L5 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cacna2d3Q9Z1L5 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cacna2d3Q9Z1L5 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cacna2d3Q9Z1L5 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cacna2d3Q9Z1L5 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cacna2d3Q9Z1L5 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cacna2d3Q9Z1L5 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cacna2d3Q9Z1L5 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cacna2d3Q9Z1L5 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cacna2d3Q9Z1L5 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cacna2d3Q9Z1L5 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cacna2d3Q9Z1L5 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cacna2d3Q9Z1L5 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cacna2d3Q9Z1L5 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cacna2d3Q9Z1L5 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cacna2d3Q9Z1L5 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cacna2d3Q9Z1L5 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cacna2d3Q9Z1L5 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cacna2d3Q9Z1L5 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cacna2d3Q9Z1L5 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cacna2d3Q9Z1L5 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cacna2d3Q9Z1L5 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cacna2d3Q9Z1L5 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cacna2d3Q9Z1L5 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cacna2d3Q9Z1L5 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cacna2d3Q9Z1L5 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cacna2d3Q9Z1L5 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cacna2d3Q9Z1L5 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cacna2d3Q9Z1L5 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cacna2d3Q9Z1L5 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cacna2d3Q9Z1L5 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cacna2d3Q9Z1L5 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cacna2d3Q9Z1L5 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cacna2d3Q9Z1L5 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cacna2d3Q9Z1L5 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cacna2d3Q9Z1L5 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cacna2d3Q9Z1L5 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cacna2d3Q9Z1L5 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cacna2d3Q9Z1L5 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cacna2d3Q9Z1L5 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cacna2d3Q9Z1L5 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cacna2d3Q9Z1L5 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cacna2d3Q9Z1L5 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cacna2d3Q9Z1L5 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cacna2d3Q9Z1L5 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cacna2d3Q9Z1L5 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cacna2d3Q9Z1L5 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cacna2d3Q9Z1L5 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cacna2d3Q9Z1L5 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cacna2d3Q9Z1L5 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cacna2d3Q9Z1L5 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cacna2d3Q9Z1L5 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cacna2d3Q9Z1L5 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cacna2d3Q9Z1L5 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cacna2d3Q9Z1L5 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cacna2d3Q9Z1L5 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cacna2d3Q9Z1L5 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cacna2d3Q9Z1L5 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cacna2d3Q9Z1L5 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cacna2d3Q9Z1L5 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cacna2d3Q9Z1L5 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cacna2d3Q9Z1L5 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cacna2d3Q9Z1L5 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cacna2d3Q9Z1L5 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cacna2d3Q9Z1L5 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cacna2d3Q9Z1L5 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cacna2d3Q9Z1L5 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cacna2d3Q9Z1L5 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cacna2d3Q9Z1L5 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cacna2d3Q9Z1L5 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cacna2d3Q9Z1L5 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cacna2d3Q9Z1L5 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cacna2d3Q9Z1L5 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cacna2d3Q9Z1L5 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cacna2d3Q9Z1L5 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cacna2d3Q9Z1L5 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cacna2d3Q9Z1L5 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cacna2d3Q9Z1L5 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cacna2d3Q9Z1L5 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cacna2d3Q9Z1L5 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cacna2d3Q9Z1L5 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms