Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z121

Ccl8, C-C motif chemokine 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl8Q9Z121 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccl8Q9Z121 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccl8Q9Z121 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccl8Q9Z121 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccl8Q9Z121 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccl8Q9Z121 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccl8Q9Z121 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccl8Q9Z121 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccl8Q9Z121 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccl8Q9Z121 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccl8Q9Z121 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccl8Q9Z121 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccl8Q9Z121 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccl8Q9Z121 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccl8Q9Z121 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccl8Q9Z121 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccl8Q9Z121 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccl8Q9Z121 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccl8Q9Z121 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccl8Q9Z121 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccl8Q9Z121 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccl8Q9Z121 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccl8Q9Z121 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccl8Q9Z121 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccl8Q9Z121 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccl8Q9Z121 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccl8Q9Z121 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccl8Q9Z121 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccl8Q9Z121 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccl8Q9Z121 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccl8Q9Z121 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccl8Q9Z121 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccl8Q9Z121 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccl8Q9Z121 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccl8Q9Z121 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccl8Q9Z121 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccl8Q9Z121 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccl8Q9Z121 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccl8Q9Z121 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccl8Q9Z121 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccl8Q9Z121 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccl8Q9Z121 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccl8Q9Z121 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccl8Q9Z121 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccl8Q9Z121 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccl8Q9Z121 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccl8Q9Z121 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccl8Q9Z121 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccl8Q9Z121 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccl8Q9Z121 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccl8Q9Z121 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccl8Q9Z121 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccl8Q9Z121 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccl8Q9Z121 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccl8Q9Z121 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccl8Q9Z121 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccl8Q9Z121 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccl8Q9Z121 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccl8Q9Z121 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccl8Q9Z121 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccl8Q9Z121 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccl8Q9Z121 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccl8Q9Z121 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccl8Q9Z121 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccl8Q9Z121 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccl8Q9Z121 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccl8Q9Z121 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccl8Q9Z121 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccl8Q9Z121 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccl8Q9Z121 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccl8Q9Z121 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccl8Q9Z121 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccl8Q9Z121 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccl8Q9Z121 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccl8Q9Z121 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccl8Q9Z121 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ccl8Q9Z121 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ccl8Q9Z121 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ccl8Q9Z121 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ccl8Q9Z121 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ccl8Q9Z121 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ccl8Q9Z121 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ccl8Q9Z121 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ccl8Q9Z121 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ccl8Q9Z121 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ccl8Q9Z121 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ccl8Q9Z121 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ccl8Q9Z121 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ccl8Q9Z121 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ccl8Q9Z121 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ccl8Q9Z121 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ccl8Q9Z121 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ccl8Q9Z121 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ccl8Q9Z121 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Ccl8Q9Z121 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ccl8Q9Z121 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Ccl8Q9Z121 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ccl8Q9Z121 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ccl8Q9Z121 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ccl8Q9Z121 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms