Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV85

Nme3, Nucleoside diphosphate kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme3Q9WV85 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nme3Q9WV85 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nme3Q9WV85 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nme3Q9WV85 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nme3Q9WV85 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nme3Q9WV85 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nme3Q9WV85 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nme3Q9WV85 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nme3Q9WV85 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nme3Q9WV85 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nme3Q9WV85 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nme3Q9WV85 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nme3Q9WV85 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nme3Q9WV85 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nme3Q9WV85 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nme3Q9WV85 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nme3Q9WV85 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nme3Q9WV85 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nme3Q9WV85 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nme3Q9WV85 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nme3Q9WV85 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nme3Q9WV85 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nme3Q9WV85 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nme3Q9WV85 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nme3Q9WV85 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nme3Q9WV85 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nme3Q9WV85 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nme3Q9WV85 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nme3Q9WV85 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nme3Q9WV85 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nme3Q9WV85 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nme3Q9WV85 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nme3Q9WV85 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nme3Q9WV85 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nme3Q9WV85 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nme3Q9WV85 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nme3Q9WV85 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Nme3Q9WV85 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nme3Q9WV85 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nme3Q9WV85 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nme3Q9WV85 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nme3Q9WV85 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nme3Q9WV85 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nme3Q9WV85 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nme3Q9WV85 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nme3Q9WV85 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nme3Q9WV85 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nme3Q9WV85 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nme3Q9WV85 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nme3Q9WV85 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nme3Q9WV85 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nme3Q9WV85 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nme3Q9WV85 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Nme3Q9WV85 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nme3Q9WV85 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nme3Q9WV85 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nme3Q9WV85 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nme3Q9WV85 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nme3Q9WV85 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nme3Q9WV85 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nme3Q9WV85 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nme3Q9WV85 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nme3Q9WV85 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nme3Q9WV85 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nme3Q9WV85 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Nme3Q9WV85 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nme3Q9WV85 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nme3Q9WV85 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nme3Q9WV85 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nme3Q9WV85 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nme3Q9WV85 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nme3Q9WV85 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Nme3Q9WV85 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Nme3Q9WV85 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Nme3Q9WV85 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Nme3Q9WV85 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Nme3Q9WV85 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nme3Q9WV85 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nme3Q9WV85 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nme3Q9WV85 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nme3Q9WV85 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nme3Q9WV85 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nme3Q9WV85 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nme3Q9WV85 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nme3Q9WV85 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nme3Q9WV85 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nme3Q9WV85 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nme3Q9WV85 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nme3Q9WV85 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nme3Q9WV85 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nme3Q9WV85 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nme3Q9WV85 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nme3Q9WV85 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nme3Q9WV85 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nme3Q9WV85 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nme3Q9WV85 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nme3Q9WV85 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nme3Q9WV85 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nme3Q9WV85 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nme3Q9WV85 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.8 ms