Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTU0

Phf2, Lysine-specific demethylase PHF2, mousemouse

Predictions only

Length 1,096 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf2Q9WTU0 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phf2Q9WTU0 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phf2Q9WTU0 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phf2Q9WTU0 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phf2Q9WTU0 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Phf2Q9WTU0 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Phf2Q9WTU0 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Phf2Q9WTU0 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Phf2Q9WTU0 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Phf2Q9WTU0 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Phf2Q9WTU0 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Phf2Q9WTU0 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Phf2Q9WTU0 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Phf2Q9WTU0 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Phf2Q9WTU0 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Phf2Q9WTU0 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Phf2Q9WTU0 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Phf2Q9WTU0 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Phf2Q9WTU0 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Phf2Q9WTU0 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Phf2Q9WTU0 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Phf2Q9WTU0 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Phf2Q9WTU0 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Phf2Q9WTU0 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Phf2Q9WTU0 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Phf2Q9WTU0 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Phf2Q9WTU0 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Phf2Q9WTU0 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Phf2Q9WTU0 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Phf2Q9WTU0 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Phf2Q9WTU0 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Phf2Q9WTU0 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Phf2Q9WTU0 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Phf2Q9WTU0 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Phf2Q9WTU0 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Phf2Q9WTU0 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Phf2Q9WTU0 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Phf2Q9WTU0 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Phf2Q9WTU0 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Phf2Q9WTU0 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Phf2Q9WTU0 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Phf2Q9WTU0 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Phf2Q9WTU0 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Phf2Q9WTU0 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Phf2Q9WTU0 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Phf2Q9WTU0 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Phf2Q9WTU0 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Phf2Q9WTU0 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Phf2Q9WTU0 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Phf2Q9WTU0 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Phf2Q9WTU0 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Phf2Q9WTU0 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Phf2Q9WTU0 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Phf2Q9WTU0 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Phf2Q9WTU0 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Phf2Q9WTU0 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Phf2Q9WTU0 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Phf2Q9WTU0 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Phf2Q9WTU0 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Phf2Q9WTU0 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
Phf2Q9WTU0 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Phf2Q9WTU0 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Phf2Q9WTU0 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Phf2Q9WTU0 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Phf2Q9WTU0 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Phf2Q9WTU0 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Phf2Q9WTU0 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Phf2Q9WTU0 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Phf2Q9WTU0 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Phf2Q9WTU0 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Phf2Q9WTU0 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Phf2Q9WTU0 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Phf2Q9WTU0 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Phf2Q9WTU0 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Phf2Q9WTU0 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Phf2Q9WTU0 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Phf2Q9WTU0 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Phf2Q9WTU0 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Phf2Q9WTU0 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Phf2Q9WTU0 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Phf2Q9WTU0 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Phf2Q9WTU0 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Phf2Q9WTU0 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Phf2Q9WTU0 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Phf2Q9WTU0 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Phf2Q9WTU0 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Phf2Q9WTU0 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Phf2Q9WTU0 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Phf2Q9WTU0 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Phf2Q9WTU0 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Phf2Q9WTU0 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Phf2Q9WTU0 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Phf2Q9WTU0 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Phf2Q9WTU0 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Phf2Q9WTU0 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Phf2Q9WTU0 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Phf2Q9WTU0 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Phf2Q9WTU0 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Phf2Q9WTU0 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Phf2Q9WTU0 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms