Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0C8

Vav3, Guanine nucleotide exchange factor VAV3, mousemouse

Predictions only

Length 847 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vav3Q9R0C8 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vav3Q9R0C8 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vav3Q9R0C8 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vav3Q9R0C8 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vav3Q9R0C8 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Vav3Q9R0C8 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vav3Q9R0C8 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vav3Q9R0C8 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Vav3Q9R0C8 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vav3Q9R0C8 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vav3Q9R0C8 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vav3Q9R0C8 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vav3Q9R0C8 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vav3Q9R0C8 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vav3Q9R0C8 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vav3Q9R0C8 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vav3Q9R0C8 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vav3Q9R0C8 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vav3Q9R0C8 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vav3Q9R0C8 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vav3Q9R0C8 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vav3Q9R0C8 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vav3Q9R0C8 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vav3Q9R0C8 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Vav3Q9R0C8 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vav3Q9R0C8 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vav3Q9R0C8 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Vav3Q9R0C8 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Vav3Q9R0C8 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Vav3Q9R0C8 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vav3Q9R0C8 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vav3Q9R0C8 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vav3Q9R0C8 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vav3Q9R0C8 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vav3Q9R0C8 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vav3Q9R0C8 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vav3Q9R0C8 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vav3Q9R0C8 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vav3Q9R0C8 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vav3Q9R0C8 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vav3Q9R0C8 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vav3Q9R0C8 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vav3Q9R0C8 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vav3Q9R0C8 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vav3Q9R0C8 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vav3Q9R0C8 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vav3Q9R0C8 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vav3Q9R0C8 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vav3Q9R0C8 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vav3Q9R0C8 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vav3Q9R0C8 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vav3Q9R0C8 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vav3Q9R0C8 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Vav3Q9R0C8 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vav3Q9R0C8 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vav3Q9R0C8 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vav3Q9R0C8 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vav3Q9R0C8 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vav3Q9R0C8 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vav3Q9R0C8 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vav3Q9R0C8 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vav3Q9R0C8 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vav3Q9R0C8 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Vav3Q9R0C8 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vav3Q9R0C8 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vav3Q9R0C8 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vav3Q9R0C8 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vav3Q9R0C8 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Vav3Q9R0C8 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vav3Q9R0C8 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vav3Q9R0C8 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vav3Q9R0C8 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vav3Q9R0C8 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vav3Q9R0C8 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vav3Q9R0C8 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vav3Q9R0C8 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vav3Q9R0C8 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vav3Q9R0C8 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vav3Q9R0C8 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vav3Q9R0C8 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vav3Q9R0C8 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vav3Q9R0C8 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vav3Q9R0C8 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vav3Q9R0C8 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vav3Q9R0C8 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vav3Q9R0C8 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vav3Q9R0C8 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Vav3Q9R0C8 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vav3Q9R0C8 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vav3Q9R0C8 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vav3Q9R0C8 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vav3Q9R0C8 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vav3Q9R0C8 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Vav3Q9R0C8 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vav3Q9R0C8 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vav3Q9R0C8 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vav3Q9R0C8 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Vav3Q9R0C8 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vav3Q9R0C8 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vav3Q9R0C8 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms