Protein–RNA interactions for Protein: Q9R087

Gpc6, Glypican-6, mousemouse

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Length 555 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc6Q9R087 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Gpc6Q9R087 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gpc6Q9R087 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gpc6Q9R087 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gpc6Q9R087 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gpc6Q9R087 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gpc6Q9R087 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gpc6Q9R087 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gpc6Q9R087 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gpc6Q9R087 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gpc6Q9R087 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gpc6Q9R087 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gpc6Q9R087 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gpc6Q9R087 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gpc6Q9R087 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gpc6Q9R087 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gpc6Q9R087 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gpc6Q9R087 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gpc6Q9R087 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gpc6Q9R087 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gpc6Q9R087 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gpc6Q9R087 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gpc6Q9R087 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gpc6Q9R087 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gpc6Q9R087 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gpc6Q9R087 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gpc6Q9R087 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gpc6Q9R087 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Gpc6Q9R087 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gpc6Q9R087 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gpc6Q9R087 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Gpc6Q9R087 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gpc6Q9R087 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gpc6Q9R087 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gpc6Q9R087 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Gpc6Q9R087 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gpc6Q9R087 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gpc6Q9R087 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gpc6Q9R087 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gpc6Q9R087 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gpc6Q9R087 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gpc6Q9R087 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gpc6Q9R087 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gpc6Q9R087 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gpc6Q9R087 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gpc6Q9R087 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gpc6Q9R087 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gpc6Q9R087 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gpc6Q9R087 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gpc6Q9R087 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gpc6Q9R087 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gpc6Q9R087 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gpc6Q9R087 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gpc6Q9R087 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Gpc6Q9R087 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gpc6Q9R087 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gpc6Q9R087 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gpc6Q9R087 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gpc6Q9R087 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gpc6Q9R087 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Gpc6Q9R087 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gpc6Q9R087 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Gpc6Q9R087 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gpc6Q9R087 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gpc6Q9R087 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gpc6Q9R087 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gpc6Q9R087 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gpc6Q9R087 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gpc6Q9R087 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gpc6Q9R087 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gpc6Q9R087 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gpc6Q9R087 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gpc6Q9R087 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gpc6Q9R087 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gpc6Q9R087 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gpc6Q9R087 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gpc6Q9R087 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gpc6Q9R087 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gpc6Q9R087 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gpc6Q9R087 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gpc6Q9R087 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gpc6Q9R087 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gpc6Q9R087 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gpc6Q9R087 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gpc6Q9R087 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gpc6Q9R087 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gpc6Q9R087 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gpc6Q9R087 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gpc6Q9R087 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gpc6Q9R087 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gpc6Q9R087 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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