Protein–RNA interactions for Protein: Q9R059

Fhl3, Four and a half LIM domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fhl3Q9R059 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fhl3Q9R059 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fhl3Q9R059 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fhl3Q9R059 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fhl3Q9R059 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fhl3Q9R059 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fhl3Q9R059 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fhl3Q9R059 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fhl3Q9R059 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fhl3Q9R059 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fhl3Q9R059 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fhl3Q9R059 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fhl3Q9R059 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fhl3Q9R059 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fhl3Q9R059 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fhl3Q9R059 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fhl3Q9R059 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fhl3Q9R059 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fhl3Q9R059 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fhl3Q9R059 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fhl3Q9R059 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fhl3Q9R059 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fhl3Q9R059 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fhl3Q9R059 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fhl3Q9R059 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Fhl3Q9R059 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fhl3Q9R059 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fhl3Q9R059 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fhl3Q9R059 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fhl3Q9R059 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fhl3Q9R059 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Fhl3Q9R059 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Fhl3Q9R059 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fhl3Q9R059 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fhl3Q9R059 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fhl3Q9R059 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fhl3Q9R059 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fhl3Q9R059 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fhl3Q9R059 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fhl3Q9R059 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fhl3Q9R059 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fhl3Q9R059 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fhl3Q9R059 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fhl3Q9R059 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fhl3Q9R059 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fhl3Q9R059 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fhl3Q9R059 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fhl3Q9R059 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fhl3Q9R059 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Fhl3Q9R059 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Fhl3Q9R059 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Fhl3Q9R059 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Fhl3Q9R059 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Fhl3Q9R059 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Fhl3Q9R059 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Fhl3Q9R059 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Fhl3Q9R059 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Fhl3Q9R059 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Fhl3Q9R059 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Fhl3Q9R059 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Fhl3Q9R059 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Fhl3Q9R059 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Fhl3Q9R059 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Fhl3Q9R059 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Fhl3Q9R059 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Fhl3Q9R059 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Fhl3Q9R059 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Fhl3Q9R059 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Fhl3Q9R059 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Fhl3Q9R059 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Fhl3Q9R059 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Fhl3Q9R059 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Fhl3Q9R059 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Fhl3Q9R059 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Fhl3Q9R059 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Fhl3Q9R059 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Fhl3Q9R059 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Fhl3Q9R059 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Fhl3Q9R059 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Fhl3Q9R059 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Fhl3Q9R059 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Fhl3Q9R059 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Fhl3Q9R059 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Fhl3Q9R059 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Fhl3Q9R059 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Fhl3Q9R059 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Fhl3Q9R059 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Fhl3Q9R059 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Fhl3Q9R059 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Fhl3Q9R059 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Fhl3Q9R059 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Fhl3Q9R059 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Fhl3Q9R059 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Fhl3Q9R059 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Fhl3Q9R059 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Fhl3Q9R059 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Fhl3Q9R059 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Fhl3Q9R059 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Fhl3Q9R059 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Fhl3Q9R059 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms