Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZM4

Tnfrsf10b, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 10B, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfrsf10bQ9QZM4 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfrsf10bQ9QZM4 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfrsf10bQ9QZM4 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfrsf10bQ9QZM4 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfrsf10bQ9QZM4 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfrsf10bQ9QZM4 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfrsf10bQ9QZM4 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfrsf10bQ9QZM4 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfrsf10bQ9QZM4 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfrsf10bQ9QZM4 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfrsf10bQ9QZM4 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfrsf10bQ9QZM4 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfrsf10bQ9QZM4 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfrsf10bQ9QZM4 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfrsf10bQ9QZM4 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfrsf10bQ9QZM4 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfrsf10bQ9QZM4 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfrsf10bQ9QZM4 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfrsf10bQ9QZM4 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfrsf10bQ9QZM4 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfrsf10bQ9QZM4 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfrsf10bQ9QZM4 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfrsf10bQ9QZM4 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfrsf10bQ9QZM4 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfrsf10bQ9QZM4 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfrsf10bQ9QZM4 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfrsf10bQ9QZM4 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfrsf10bQ9QZM4 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tnfrsf10bQ9QZM4 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Tnfrsf10bQ9QZM4 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms