Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY53

Nphp1, Nephrocystin-1, mousemouse

Predictions only

Length 687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp1Q9QY53 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nphp1Q9QY53 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Nphp1Q9QY53 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Nphp1Q9QY53 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Nphp1Q9QY53 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nphp1Q9QY53 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nphp1Q9QY53 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nphp1Q9QY53 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nphp1Q9QY53 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nphp1Q9QY53 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nphp1Q9QY53 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nphp1Q9QY53 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nphp1Q9QY53 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nphp1Q9QY53 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nphp1Q9QY53 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nphp1Q9QY53 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nphp1Q9QY53 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nphp1Q9QY53 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nphp1Q9QY53 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nphp1Q9QY53 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nphp1Q9QY53 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nphp1Q9QY53 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Nphp1Q9QY53 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Nphp1Q9QY53 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nphp1Q9QY53 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Nphp1Q9QY53 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Nphp1Q9QY53 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nphp1Q9QY53 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nphp1Q9QY53 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nphp1Q9QY53 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nphp1Q9QY53 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nphp1Q9QY53 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nphp1Q9QY53 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nphp1Q9QY53 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nphp1Q9QY53 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nphp1Q9QY53 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nphp1Q9QY53 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nphp1Q9QY53 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nphp1Q9QY53 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nphp1Q9QY53 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nphp1Q9QY53 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nphp1Q9QY53 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nphp1Q9QY53 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nphp1Q9QY53 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nphp1Q9QY53 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nphp1Q9QY53 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nphp1Q9QY53 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nphp1Q9QY53 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nphp1Q9QY53 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nphp1Q9QY53 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nphp1Q9QY53 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nphp1Q9QY53 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nphp1Q9QY53 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nphp1Q9QY53 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nphp1Q9QY53 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nphp1Q9QY53 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nphp1Q9QY53 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nphp1Q9QY53 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nphp1Q9QY53 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nphp1Q9QY53 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nphp1Q9QY53 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nphp1Q9QY53 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nphp1Q9QY53 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nphp1Q9QY53 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nphp1Q9QY53 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nphp1Q9QY53 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nphp1Q9QY53 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nphp1Q9QY53 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nphp1Q9QY53 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nphp1Q9QY53 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nphp1Q9QY53 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nphp1Q9QY53 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nphp1Q9QY53 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nphp1Q9QY53 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nphp1Q9QY53 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nphp1Q9QY53 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nphp1Q9QY53 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Nphp1Q9QY53 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nphp1Q9QY53 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nphp1Q9QY53 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nphp1Q9QY53 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nphp1Q9QY53 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nphp1Q9QY53 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nphp1Q9QY53 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nphp1Q9QY53 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nphp1Q9QY53 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nphp1Q9QY53 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nphp1Q9QY53 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nphp1Q9QY53 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nphp1Q9QY53 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nphp1Q9QY53 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nphp1Q9QY53 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nphp1Q9QY53 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nphp1Q9QY53 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nphp1Q9QY53 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nphp1Q9QY53 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nphp1Q9QY53 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nphp1Q9QY53 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nphp1Q9QY53 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nphp1Q9QY53 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms