Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK7

Cpsf3, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 3, mousemouse

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Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf3Q9QXK7 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cpsf3Q9QXK7 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cpsf3Q9QXK7 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cpsf3Q9QXK7 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cpsf3Q9QXK7 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cpsf3Q9QXK7 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cpsf3Q9QXK7 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cpsf3Q9QXK7 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cpsf3Q9QXK7 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cpsf3Q9QXK7 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cpsf3Q9QXK7 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cpsf3Q9QXK7 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cpsf3Q9QXK7 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cpsf3Q9QXK7 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cpsf3Q9QXK7 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cpsf3Q9QXK7 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cpsf3Q9QXK7 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cpsf3Q9QXK7 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cpsf3Q9QXK7 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cpsf3Q9QXK7 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cpsf3Q9QXK7 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cpsf3Q9QXK7 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cpsf3Q9QXK7 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cpsf3Q9QXK7 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cpsf3Q9QXK7 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cpsf3Q9QXK7 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cpsf3Q9QXK7 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cpsf3Q9QXK7 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cpsf3Q9QXK7 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cpsf3Q9QXK7 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cpsf3Q9QXK7 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cpsf3Q9QXK7 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cpsf3Q9QXK7 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cpsf3Q9QXK7 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cpsf3Q9QXK7 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cpsf3Q9QXK7 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cpsf3Q9QXK7 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cpsf3Q9QXK7 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cpsf3Q9QXK7 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cpsf3Q9QXK7 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cpsf3Q9QXK7 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cpsf3Q9QXK7 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cpsf3Q9QXK7 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cpsf3Q9QXK7 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cpsf3Q9QXK7 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cpsf3Q9QXK7 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cpsf3Q9QXK7 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cpsf3Q9QXK7 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cpsf3Q9QXK7 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cpsf3Q9QXK7 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cpsf3Q9QXK7 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cpsf3Q9QXK7 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cpsf3Q9QXK7 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cpsf3Q9QXK7 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cpsf3Q9QXK7 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cpsf3Q9QXK7 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cpsf3Q9QXK7 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cpsf3Q9QXK7 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cpsf3Q9QXK7 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cpsf3Q9QXK7 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cpsf3Q9QXK7 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cpsf3Q9QXK7 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cpsf3Q9QXK7 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cpsf3Q9QXK7 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cpsf3Q9QXK7 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cpsf3Q9QXK7 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cpsf3Q9QXK7 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cpsf3Q9QXK7 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cpsf3Q9QXK7 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
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Cpsf3Q9QXK7 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cpsf3Q9QXK7 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cpsf3Q9QXK7 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cpsf3Q9QXK7 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cpsf3Q9QXK7 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cpsf3Q9QXK7 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cpsf3Q9QXK7 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cpsf3Q9QXK7 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cpsf3Q9QXK7 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cpsf3Q9QXK7 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cpsf3Q9QXK7 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cpsf3Q9QXK7 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cpsf3Q9QXK7 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cpsf3Q9QXK7 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cpsf3Q9QXK7 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cpsf3Q9QXK7 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cpsf3Q9QXK7 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cpsf3Q9QXK7 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cpsf3Q9QXK7 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cpsf3Q9QXK7 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cpsf3Q9QXK7 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cpsf3Q9QXK7 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cpsf3Q9QXK7 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cpsf3Q9QXK7 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cpsf3Q9QXK7 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cpsf3Q9QXK7 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cpsf3Q9QXK7 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cpsf3Q9QXK7 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cpsf3Q9QXK7 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cpsf3Q9QXK7 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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