Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM73

Srf, Serum response factor, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrfQ9JM73 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SrfQ9JM73 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SrfQ9JM73 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SrfQ9JM73 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SrfQ9JM73 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SrfQ9JM73 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SrfQ9JM73 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SrfQ9JM73 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SrfQ9JM73 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
SrfQ9JM73 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SrfQ9JM73 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SrfQ9JM73 Prl8a1-201ENSMUST00000006664 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SrfQ9JM73 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SrfQ9JM73 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SrfQ9JM73 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
SrfQ9JM73 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SrfQ9JM73 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SrfQ9JM73 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SrfQ9JM73 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SrfQ9JM73 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SrfQ9JM73 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SrfQ9JM73 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SrfQ9JM73 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SrfQ9JM73 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
SrfQ9JM73 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
SrfQ9JM73 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SrfQ9JM73 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SrfQ9JM73 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SrfQ9JM73 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SrfQ9JM73 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SrfQ9JM73 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SrfQ9JM73 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SrfQ9JM73 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SrfQ9JM73 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SrfQ9JM73 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SrfQ9JM73 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SrfQ9JM73 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SrfQ9JM73 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SrfQ9JM73 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SrfQ9JM73 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SrfQ9JM73 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SrfQ9JM73 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SrfQ9JM73 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SrfQ9JM73 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SrfQ9JM73 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SrfQ9JM73 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SrfQ9JM73 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SrfQ9JM73 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SrfQ9JM73 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SrfQ9JM73 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SrfQ9JM73 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SrfQ9JM73 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SrfQ9JM73 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SrfQ9JM73 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SrfQ9JM73 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SrfQ9JM73 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SrfQ9JM73 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SrfQ9JM73 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SrfQ9JM73 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SrfQ9JM73 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
SrfQ9JM73 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SrfQ9JM73 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SrfQ9JM73 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SrfQ9JM73 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SrfQ9JM73 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SrfQ9JM73 Gm20815-201ENSMUST00000115496 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SrfQ9JM73 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SrfQ9JM73 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SrfQ9JM73 Gm21812-202ENSMUST00000188908 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SrfQ9JM73 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
SrfQ9JM73 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SrfQ9JM73 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SrfQ9JM73 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SrfQ9JM73 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SrfQ9JM73 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SrfQ9JM73 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SrfQ9JM73 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SrfQ9JM73 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SrfQ9JM73 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SrfQ9JM73 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
SrfQ9JM73 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SrfQ9JM73 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SrfQ9JM73 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SrfQ9JM73 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SrfQ9JM73 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SrfQ9JM73 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SrfQ9JM73 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SrfQ9JM73 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SrfQ9JM73 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SrfQ9JM73 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SrfQ9JM73 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SrfQ9JM73 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SrfQ9JM73 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SrfQ9JM73 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SrfQ9JM73 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SrfQ9JM73 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SrfQ9JM73 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SrfQ9JM73 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SrfQ9JM73 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SrfQ9JM73 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms