Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM58

Crlf1, Cytokine receptor-like factor 1, mousemouse

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Length 425 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crlf1Q9JM58 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Crlf1Q9JM58 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Crlf1Q9JM58 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Crlf1Q9JM58 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Crlf1Q9JM58 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Crlf1Q9JM58 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Crlf1Q9JM58 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Crlf1Q9JM58 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Crlf1Q9JM58 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Crlf1Q9JM58 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Crlf1Q9JM58 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Crlf1Q9JM58 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Crlf1Q9JM58 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Crlf1Q9JM58 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Crlf1Q9JM58 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Crlf1Q9JM58 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Crlf1Q9JM58 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Crlf1Q9JM58 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Crlf1Q9JM58 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Crlf1Q9JM58 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Crlf1Q9JM58 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Crlf1Q9JM58 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Crlf1Q9JM58 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Crlf1Q9JM58 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Crlf1Q9JM58 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Crlf1Q9JM58 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Crlf1Q9JM58 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Crlf1Q9JM58 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Crlf1Q9JM58 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Crlf1Q9JM58 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Crlf1Q9JM58 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Crlf1Q9JM58 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Crlf1Q9JM58 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Crlf1Q9JM58 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Crlf1Q9JM58 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Crlf1Q9JM58 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Crlf1Q9JM58 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Crlf1Q9JM58 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Crlf1Q9JM58 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Crlf1Q9JM58 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Crlf1Q9JM58 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Crlf1Q9JM58 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Crlf1Q9JM58 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Crlf1Q9JM58 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Crlf1Q9JM58 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Crlf1Q9JM58 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Crlf1Q9JM58 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Crlf1Q9JM58 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Crlf1Q9JM58 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Crlf1Q9JM58 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Crlf1Q9JM58 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Crlf1Q9JM58 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Crlf1Q9JM58 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Crlf1Q9JM58 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Crlf1Q9JM58 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Crlf1Q9JM58 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Crlf1Q9JM58 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Crlf1Q9JM58 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Crlf1Q9JM58 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Crlf1Q9JM58 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Crlf1Q9JM58 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
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Crlf1Q9JM58 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Crlf1Q9JM58 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Crlf1Q9JM58 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Crlf1Q9JM58 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Crlf1Q9JM58 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Crlf1Q9JM58 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Crlf1Q9JM58 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Crlf1Q9JM58 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Crlf1Q9JM58 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Crlf1Q9JM58 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Crlf1Q9JM58 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Crlf1Q9JM58 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Crlf1Q9JM58 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Crlf1Q9JM58 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Crlf1Q9JM58 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Crlf1Q9JM58 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Crlf1Q9JM58 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Crlf1Q9JM58 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Crlf1Q9JM58 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Crlf1Q9JM58 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Crlf1Q9JM58 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Crlf1Q9JM58 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Crlf1Q9JM58 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Crlf1Q9JM58 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Crlf1Q9JM58 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Crlf1Q9JM58 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Crlf1Q9JM58 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Crlf1Q9JM58 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Crlf1Q9JM58 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Crlf1Q9JM58 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Crlf1Q9JM58 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Crlf1Q9JM58 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Crlf1Q9JM58 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms