Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Col5a3Q9JLI2 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Col5a3Q9JLI2 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Col5a3Q9JLI2 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col5a3Q9JLI2 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col5a3Q9JLI2 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col5a3Q9JLI2 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Col5a3Q9JLI2 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Col5a3Q9JLI2 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Col5a3Q9JLI2 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Col5a3Q9JLI2 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Col5a3Q9JLI2 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Col5a3Q9JLI2 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Col5a3Q9JLI2 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Col5a3Q9JLI2 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col5a3Q9JLI2 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col5a3Q9JLI2 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col5a3Q9JLI2 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col5a3Q9JLI2 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col5a3Q9JLI2 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col5a3Q9JLI2 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
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Col5a3Q9JLI2 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col5a3Q9JLI2 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col5a3Q9JLI2 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col5a3Q9JLI2 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Col5a3Q9JLI2 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col5a3Q9JLI2 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col5a3Q9JLI2 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Col5a3Q9JLI2 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col5a3Q9JLI2 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col5a3Q9JLI2 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col5a3Q9JLI2 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col5a3Q9JLI2 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Col5a3Q9JLI2 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col5a3Q9JLI2 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Col5a3Q9JLI2 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Col5a3Q9JLI2 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col5a3Q9JLI2 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col5a3Q9JLI2 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC15.04■□□□□ -0
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Col5a3Q9JLI2 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col5a3Q9JLI2 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col5a3Q9JLI2 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col5a3Q9JLI2 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col5a3Q9JLI2 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col5a3Q9JLI2 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col5a3Q9JLI2 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col5a3Q9JLI2 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Col5a3Q9JLI2 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col5a3Q9JLI2 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Col5a3Q9JLI2 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col5a3Q9JLI2 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col5a3Q9JLI2 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col5a3Q9JLI2 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col5a3Q9JLI2 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col5a3Q9JLI2 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col5a3Q9JLI2 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col5a3Q9JLI2 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Col5a3Q9JLI2 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Col5a3Q9JLI2 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Col5a3Q9JLI2 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Col5a3Q9JLI2 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Col5a3Q9JLI2 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Col5a3Q9JLI2 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Col5a3Q9JLI2 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC15.03■□□□□ -0
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Col5a3Q9JLI2 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Col5a3Q9JLI2 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Col5a3Q9JLI2 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Col5a3Q9JLI2 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Col5a3Q9JLI2 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Col5a3Q9JLI2 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Col5a3Q9JLI2 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Col5a3Q9JLI2 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Col5a3Q9JLI2 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Col5a3Q9JLI2 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Col5a3Q9JLI2 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Col5a3Q9JLI2 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Col5a3Q9JLI2 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Col5a3Q9JLI2 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Col5a3Q9JLI2 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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