Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF6

Tgm1, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase K, mousemouse

Predictions only

Length 815 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm1Q9JLF6 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Tgm1Q9JLF6 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Tgm1Q9JLF6 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Tgm1Q9JLF6 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Tgm1Q9JLF6 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Tgm1Q9JLF6 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Tgm1Q9JLF6 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Tgm1Q9JLF6 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Tgm1Q9JLF6 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Tgm1Q9JLF6 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Tgm1Q9JLF6 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Tgm1Q9JLF6 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Tgm1Q9JLF6 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Tgm1Q9JLF6 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Tgm1Q9JLF6 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Tgm1Q9JLF6 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
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Tgm1Q9JLF6 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Tgm1Q9JLF6 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Tgm1Q9JLF6 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Tgm1Q9JLF6 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Tgm1Q9JLF6 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Tgm1Q9JLF6 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Tgm1Q9JLF6 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Tgm1Q9JLF6 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
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Tgm1Q9JLF6 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
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Tgm1Q9JLF6 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Tgm1Q9JLF6 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Tgm1Q9JLF6 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
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Tgm1Q9JLF6 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Tgm1Q9JLF6 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Tgm1Q9JLF6 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
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Tgm1Q9JLF6 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Tgm1Q9JLF6 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Tgm1Q9JLF6 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
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Tgm1Q9JLF6 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Tgm1Q9JLF6 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Tgm1Q9JLF6 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Tgm1Q9JLF6 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
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Tgm1Q9JLF6 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Tgm1Q9JLF6 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Tgm1Q9JLF6 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Tgm1Q9JLF6 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Tgm1Q9JLF6 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Tgm1Q9JLF6 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Tgm1Q9JLF6 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
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Tgm1Q9JLF6 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Tgm1Q9JLF6 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Tgm1Q9JLF6 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Tgm1Q9JLF6 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Tgm1Q9JLF6 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Tgm1Q9JLF6 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Tgm1Q9JLF6 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Tgm1Q9JLF6 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Tgm1Q9JLF6 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Tgm1Q9JLF6 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Tgm1Q9JLF6 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Tgm1Q9JLF6 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Tgm1Q9JLF6 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Tgm1Q9JLF6 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Tgm1Q9JLF6 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Tgm1Q9JLF6 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Tgm1Q9JLF6 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Tgm1Q9JLF6 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Tgm1Q9JLF6 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Tgm1Q9JLF6 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Tgm1Q9JLF6 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Tgm1Q9JLF6 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Tgm1Q9JLF6 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Tgm1Q9JLF6 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms