Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK7

Tmod2, Tropomodulin-2, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod2Q9JKK7 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tmod2Q9JKK7 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tmod2Q9JKK7 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tmod2Q9JKK7 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tmod2Q9JKK7 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tmod2Q9JKK7 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tmod2Q9JKK7 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tmod2Q9JKK7 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tmod2Q9JKK7 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmod2Q9JKK7 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmod2Q9JKK7 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmod2Q9JKK7 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmod2Q9JKK7 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmod2Q9JKK7 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmod2Q9JKK7 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmod2Q9JKK7 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmod2Q9JKK7 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmod2Q9JKK7 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmod2Q9JKK7 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmod2Q9JKK7 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmod2Q9JKK7 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmod2Q9JKK7 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmod2Q9JKK7 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmod2Q9JKK7 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmod2Q9JKK7 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmod2Q9JKK7 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmod2Q9JKK7 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmod2Q9JKK7 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmod2Q9JKK7 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmod2Q9JKK7 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmod2Q9JKK7 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmod2Q9JKK7 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmod2Q9JKK7 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmod2Q9JKK7 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmod2Q9JKK7 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmod2Q9JKK7 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmod2Q9JKK7 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmod2Q9JKK7 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmod2Q9JKK7 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmod2Q9JKK7 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmod2Q9JKK7 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmod2Q9JKK7 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmod2Q9JKK7 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmod2Q9JKK7 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmod2Q9JKK7 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmod2Q9JKK7 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmod2Q9JKK7 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmod2Q9JKK7 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmod2Q9JKK7 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmod2Q9JKK7 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmod2Q9JKK7 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmod2Q9JKK7 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmod2Q9JKK7 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmod2Q9JKK7 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmod2Q9JKK7 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmod2Q9JKK7 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmod2Q9JKK7 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmod2Q9JKK7 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmod2Q9JKK7 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmod2Q9JKK7 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmod2Q9JKK7 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmod2Q9JKK7 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmod2Q9JKK7 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmod2Q9JKK7 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmod2Q9JKK7 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmod2Q9JKK7 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmod2Q9JKK7 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmod2Q9JKK7 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmod2Q9JKK7 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmod2Q9JKK7 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmod2Q9JKK7 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmod2Q9JKK7 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmod2Q9JKK7 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmod2Q9JKK7 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmod2Q9JKK7 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmod2Q9JKK7 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmod2Q9JKK7 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmod2Q9JKK7 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmod2Q9JKK7 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmod2Q9JKK7 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmod2Q9JKK7 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmod2Q9JKK7 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmod2Q9JKK7 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmod2Q9JKK7 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmod2Q9JKK7 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmod2Q9JKK7 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmod2Q9JKK7 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmod2Q9JKK7 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmod2Q9JKK7 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmod2Q9JKK7 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmod2Q9JKK7 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmod2Q9JKK7 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmod2Q9JKK7 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmod2Q9JKK7 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmod2Q9JKK7 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmod2Q9JKK7 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmod2Q9JKK7 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmod2Q9JKK7 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmod2Q9JKK7 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmod2Q9JKK7 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms