Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1cc1Q9ESK9 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
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Rb1cc1Q9ESK9 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rb1cc1Q9ESK9 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rb1cc1Q9ESK9 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rb1cc1Q9ESK9 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rb1cc1Q9ESK9 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rb1cc1Q9ESK9 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rb1cc1Q9ESK9 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rb1cc1Q9ESK9 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Rb1cc1Q9ESK9 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rb1cc1Q9ESK9 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rb1cc1Q9ESK9 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rb1cc1Q9ESK9 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rb1cc1Q9ESK9 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rb1cc1Q9ESK9 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rb1cc1Q9ESK9 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Rb1cc1Q9ESK9 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Rb1cc1Q9ESK9 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Rb1cc1Q9ESK9 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rb1cc1Q9ESK9 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rb1cc1Q9ESK9 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rb1cc1Q9ESK9 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rb1cc1Q9ESK9 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rb1cc1Q9ESK9 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rb1cc1Q9ESK9 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Rb1cc1Q9ESK9 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
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Rb1cc1Q9ESK9 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Rb1cc1Q9ESK9 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Rb1cc1Q9ESK9 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Rb1cc1Q9ESK9 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Rb1cc1Q9ESK9 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Rb1cc1Q9ESK9 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Rb1cc1Q9ESK9 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
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Rb1cc1Q9ESK9 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Rb1cc1Q9ESK9 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
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Rb1cc1Q9ESK9 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Rb1cc1Q9ESK9 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Rb1cc1Q9ESK9 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
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Rb1cc1Q9ESK9 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rb1cc1Q9ESK9 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rb1cc1Q9ESK9 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rb1cc1Q9ESK9 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rb1cc1Q9ESK9 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rb1cc1Q9ESK9 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rb1cc1Q9ESK9 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rb1cc1Q9ESK9 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rb1cc1Q9ESK9 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rb1cc1Q9ESK9 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rb1cc1Q9ESK9 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rb1cc1Q9ESK9 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rb1cc1Q9ESK9 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rb1cc1Q9ESK9 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rb1cc1Q9ESK9 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rb1cc1Q9ESK9 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rb1cc1Q9ESK9 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rb1cc1Q9ESK9 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rb1cc1Q9ESK9 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rb1cc1Q9ESK9 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Rb1cc1Q9ESK9 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rb1cc1Q9ESK9 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rb1cc1Q9ESK9 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rb1cc1Q9ESK9 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rb1cc1Q9ESK9 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rb1cc1Q9ESK9 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
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