Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1Q9EPL2 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Clstn1Q9EPL2 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Clstn1Q9EPL2 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Clstn1Q9EPL2 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Clstn1Q9EPL2 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Clstn1Q9EPL2 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Clstn1Q9EPL2 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Clstn1Q9EPL2 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Clstn1Q9EPL2 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Clstn1Q9EPL2 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Clstn1Q9EPL2 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Clstn1Q9EPL2 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Clstn1Q9EPL2 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Clstn1Q9EPL2 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Clstn1Q9EPL2 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Clstn1Q9EPL2 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Clstn1Q9EPL2 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Clstn1Q9EPL2 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Clstn1Q9EPL2 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Clstn1Q9EPL2 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Clstn1Q9EPL2 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Clstn1Q9EPL2 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Clstn1Q9EPL2 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Clstn1Q9EPL2 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Clstn1Q9EPL2 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Clstn1Q9EPL2 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Clstn1Q9EPL2 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Clstn1Q9EPL2 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Clstn1Q9EPL2 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Clstn1Q9EPL2 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Clstn1Q9EPL2 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Clstn1Q9EPL2 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Clstn1Q9EPL2 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Clstn1Q9EPL2 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Clstn1Q9EPL2 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Clstn1Q9EPL2 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Clstn1Q9EPL2 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Clstn1Q9EPL2 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Clstn1Q9EPL2 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Clstn1Q9EPL2 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Clstn1Q9EPL2 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Clstn1Q9EPL2 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Clstn1Q9EPL2 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Clstn1Q9EPL2 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Clstn1Q9EPL2 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Clstn1Q9EPL2 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Clstn1Q9EPL2 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Clstn1Q9EPL2 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Clstn1Q9EPL2 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Clstn1Q9EPL2 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Clstn1Q9EPL2 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Clstn1Q9EPL2 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Clstn1Q9EPL2 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Clstn1Q9EPL2 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Clstn1Q9EPL2 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Clstn1Q9EPL2 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Clstn1Q9EPL2 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Clstn1Q9EPL2 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Clstn1Q9EPL2 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Clstn1Q9EPL2 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Clstn1Q9EPL2 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Clstn1Q9EPL2 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Clstn1Q9EPL2 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Clstn1Q9EPL2 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Clstn1Q9EPL2 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Clstn1Q9EPL2 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Clstn1Q9EPL2 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Clstn1Q9EPL2 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Clstn1Q9EPL2 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Clstn1Q9EPL2 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Clstn1Q9EPL2 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Clstn1Q9EPL2 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Clstn1Q9EPL2 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Clstn1Q9EPL2 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Clstn1Q9EPL2 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Clstn1Q9EPL2 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Clstn1Q9EPL2 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Clstn1Q9EPL2 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Clstn1Q9EPL2 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Clstn1Q9EPL2 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Clstn1Q9EPL2 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Clstn1Q9EPL2 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Clstn1Q9EPL2 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Clstn1Q9EPL2 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Clstn1Q9EPL2 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Clstn1Q9EPL2 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Clstn1Q9EPL2 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Clstn1Q9EPL2 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Clstn1Q9EPL2 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Clstn1Q9EPL2 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Clstn1Q9EPL2 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Clstn1Q9EPL2 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Clstn1Q9EPL2 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Clstn1Q9EPL2 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Clstn1Q9EPL2 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Clstn1Q9EPL2 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Clstn1Q9EPL2 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Clstn1Q9EPL2 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Clstn1Q9EPL2 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Clstn1Q9EPL2 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms