Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCU6

Mrpl4, 39S ribosomal protein L4, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl4Q9DCU6 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mrpl4Q9DCU6 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mrpl4Q9DCU6 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mrpl4Q9DCU6 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mrpl4Q9DCU6 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mrpl4Q9DCU6 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mrpl4Q9DCU6 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mrpl4Q9DCU6 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mrpl4Q9DCU6 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mrpl4Q9DCU6 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mrpl4Q9DCU6 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mrpl4Q9DCU6 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mrpl4Q9DCU6 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mrpl4Q9DCU6 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mrpl4Q9DCU6 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mrpl4Q9DCU6 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mrpl4Q9DCU6 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mrpl4Q9DCU6 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mrpl4Q9DCU6 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Mrpl4Q9DCU6 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mrpl4Q9DCU6 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mrpl4Q9DCU6 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mrpl4Q9DCU6 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mrpl4Q9DCU6 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mrpl4Q9DCU6 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mrpl4Q9DCU6 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mrpl4Q9DCU6 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mrpl4Q9DCU6 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mrpl4Q9DCU6 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mrpl4Q9DCU6 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mrpl4Q9DCU6 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mrpl4Q9DCU6 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mrpl4Q9DCU6 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mrpl4Q9DCU6 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mrpl4Q9DCU6 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mrpl4Q9DCU6 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mrpl4Q9DCU6 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mrpl4Q9DCU6 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mrpl4Q9DCU6 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mrpl4Q9DCU6 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mrpl4Q9DCU6 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Mrpl4Q9DCU6 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mrpl4Q9DCU6 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mrpl4Q9DCU6 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mrpl4Q9DCU6 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mrpl4Q9DCU6 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mrpl4Q9DCU6 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mrpl4Q9DCU6 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mrpl4Q9DCU6 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Mrpl4Q9DCU6 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mrpl4Q9DCU6 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mrpl4Q9DCU6 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Mrpl4Q9DCU6 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Mrpl4Q9DCU6 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Mrpl4Q9DCU6 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mrpl4Q9DCU6 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Mrpl4Q9DCU6 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Mrpl4Q9DCU6 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mrpl4Q9DCU6 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Mrpl4Q9DCU6 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mrpl4Q9DCU6 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mrpl4Q9DCU6 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mrpl4Q9DCU6 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mrpl4Q9DCU6 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mrpl4Q9DCU6 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mrpl4Q9DCU6 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Mrpl4Q9DCU6 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Mrpl4Q9DCU6 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Mrpl4Q9DCU6 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Mrpl4Q9DCU6 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Mrpl4Q9DCU6 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Mrpl4Q9DCU6 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Mrpl4Q9DCU6 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Mrpl4Q9DCU6 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mrpl4Q9DCU6 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mrpl4Q9DCU6 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mrpl4Q9DCU6 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mrpl4Q9DCU6 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mrpl4Q9DCU6 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mrpl4Q9DCU6 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mrpl4Q9DCU6 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Mrpl4Q9DCU6 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mrpl4Q9DCU6 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mrpl4Q9DCU6 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mrpl4Q9DCU6 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mrpl4Q9DCU6 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mrpl4Q9DCU6 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mrpl4Q9DCU6 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Mrpl4Q9DCU6 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Mrpl4Q9DCU6 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mrpl4Q9DCU6 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Mrpl4Q9DCU6 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mrpl4Q9DCU6 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Mrpl4Q9DCU6 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mrpl4Q9DCU6 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mrpl4Q9DCU6 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mrpl4Q9DCU6 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Mrpl4Q9DCU6 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mrpl4Q9DCU6 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mrpl4Q9DCU6 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms