Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCG9

Trmt112, Multifunctional methyltransferase subunit TRM112-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt112Q9DCG9 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trmt112Q9DCG9 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trmt112Q9DCG9 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trmt112Q9DCG9 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trmt112Q9DCG9 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trmt112Q9DCG9 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trmt112Q9DCG9 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trmt112Q9DCG9 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trmt112Q9DCG9 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Trmt112Q9DCG9 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Trmt112Q9DCG9 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trmt112Q9DCG9 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trmt112Q9DCG9 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trmt112Q9DCG9 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trmt112Q9DCG9 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trmt112Q9DCG9 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trmt112Q9DCG9 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trmt112Q9DCG9 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trmt112Q9DCG9 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Trmt112Q9DCG9 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trmt112Q9DCG9 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trmt112Q9DCG9 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trmt112Q9DCG9 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trmt112Q9DCG9 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trmt112Q9DCG9 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trmt112Q9DCG9 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trmt112Q9DCG9 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trmt112Q9DCG9 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trmt112Q9DCG9 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trmt112Q9DCG9 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trmt112Q9DCG9 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trmt112Q9DCG9 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trmt112Q9DCG9 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trmt112Q9DCG9 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trmt112Q9DCG9 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trmt112Q9DCG9 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trmt112Q9DCG9 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trmt112Q9DCG9 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trmt112Q9DCG9 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trmt112Q9DCG9 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Trmt112Q9DCG9 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Trmt112Q9DCG9 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Trmt112Q9DCG9 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Trmt112Q9DCG9 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trmt112Q9DCG9 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trmt112Q9DCG9 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Trmt112Q9DCG9 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Trmt112Q9DCG9 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Trmt112Q9DCG9 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trmt112Q9DCG9 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trmt112Q9DCG9 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trmt112Q9DCG9 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trmt112Q9DCG9 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trmt112Q9DCG9 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trmt112Q9DCG9 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trmt112Q9DCG9 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trmt112Q9DCG9 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trmt112Q9DCG9 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trmt112Q9DCG9 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trmt112Q9DCG9 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trmt112Q9DCG9 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trmt112Q9DCG9 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trmt112Q9DCG9 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trmt112Q9DCG9 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trmt112Q9DCG9 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trmt112Q9DCG9 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trmt112Q9DCG9 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trmt112Q9DCG9 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trmt112Q9DCG9 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trmt112Q9DCG9 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trmt112Q9DCG9 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Trmt112Q9DCG9 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trmt112Q9DCG9 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trmt112Q9DCG9 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trmt112Q9DCG9 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Trmt112Q9DCG9 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Trmt112Q9DCG9 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trmt112Q9DCG9 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trmt112Q9DCG9 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trmt112Q9DCG9 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trmt112Q9DCG9 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trmt112Q9DCG9 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trmt112Q9DCG9 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trmt112Q9DCG9 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Trmt112Q9DCG9 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trmt112Q9DCG9 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trmt112Q9DCG9 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trmt112Q9DCG9 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trmt112Q9DCG9 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trmt112Q9DCG9 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trmt112Q9DCG9 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trmt112Q9DCG9 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trmt112Q9DCG9 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trmt112Q9DCG9 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trmt112Q9DCG9 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trmt112Q9DCG9 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trmt112Q9DCG9 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Trmt112Q9DCG9 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Trmt112Q9DCG9 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trmt112Q9DCG9 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms