Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCE5

Pak1ip1, p21-activated protein kinase-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pak1ip1Q9DCE5 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pak1ip1Q9DCE5 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pak1ip1Q9DCE5 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pak1ip1Q9DCE5 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pak1ip1Q9DCE5 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pak1ip1Q9DCE5 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pak1ip1Q9DCE5 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pak1ip1Q9DCE5 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pak1ip1Q9DCE5 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pak1ip1Q9DCE5 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pak1ip1Q9DCE5 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Pak1ip1Q9DCE5 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pak1ip1Q9DCE5 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pak1ip1Q9DCE5 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pak1ip1Q9DCE5 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pak1ip1Q9DCE5 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Pak1ip1Q9DCE5 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pak1ip1Q9DCE5 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pak1ip1Q9DCE5 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pak1ip1Q9DCE5 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pak1ip1Q9DCE5 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pak1ip1Q9DCE5 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Pak1ip1Q9DCE5 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pak1ip1Q9DCE5 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pak1ip1Q9DCE5 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pak1ip1Q9DCE5 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pak1ip1Q9DCE5 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pak1ip1Q9DCE5 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pak1ip1Q9DCE5 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pak1ip1Q9DCE5 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pak1ip1Q9DCE5 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pak1ip1Q9DCE5 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pak1ip1Q9DCE5 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pak1ip1Q9DCE5 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pak1ip1Q9DCE5 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Pak1ip1Q9DCE5 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pak1ip1Q9DCE5 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pak1ip1Q9DCE5 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pak1ip1Q9DCE5 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pak1ip1Q9DCE5 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Pak1ip1Q9DCE5 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pak1ip1Q9DCE5 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pak1ip1Q9DCE5 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pak1ip1Q9DCE5 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pak1ip1Q9DCE5 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pak1ip1Q9DCE5 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Pak1ip1Q9DCE5 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pak1ip1Q9DCE5 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pak1ip1Q9DCE5 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pak1ip1Q9DCE5 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pak1ip1Q9DCE5 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pak1ip1Q9DCE5 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pak1ip1Q9DCE5 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pak1ip1Q9DCE5 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pak1ip1Q9DCE5 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pak1ip1Q9DCE5 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Pak1ip1Q9DCE5 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pak1ip1Q9DCE5 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Pak1ip1Q9DCE5 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pak1ip1Q9DCE5 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pak1ip1Q9DCE5 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pak1ip1Q9DCE5 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pak1ip1Q9DCE5 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pak1ip1Q9DCE5 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pak1ip1Q9DCE5 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Pak1ip1Q9DCE5 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Pak1ip1Q9DCE5 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Pak1ip1Q9DCE5 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pak1ip1Q9DCE5 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Pak1ip1Q9DCE5 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pak1ip1Q9DCE5 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Pak1ip1Q9DCE5 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Pak1ip1Q9DCE5 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Pak1ip1Q9DCE5 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pak1ip1Q9DCE5 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pak1ip1Q9DCE5 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pak1ip1Q9DCE5 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pak1ip1Q9DCE5 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pak1ip1Q9DCE5 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Pak1ip1Q9DCE5 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pak1ip1Q9DCE5 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Pak1ip1Q9DCE5 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pak1ip1Q9DCE5 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Pak1ip1Q9DCE5 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Pak1ip1Q9DCE5 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pak1ip1Q9DCE5 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pak1ip1Q9DCE5 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pak1ip1Q9DCE5 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pak1ip1Q9DCE5 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pak1ip1Q9DCE5 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Pak1ip1Q9DCE5 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pak1ip1Q9DCE5 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pak1ip1Q9DCE5 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pak1ip1Q9DCE5 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pak1ip1Q9DCE5 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pak1ip1Q9DCE5 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pak1ip1Q9DCE5 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Pak1ip1Q9DCE5 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pak1ip1Q9DCE5 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pak1ip1Q9DCE5 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms