Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCD2

Xab2, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xab2Q9DCD2 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Xab2Q9DCD2 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Xab2Q9DCD2 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Xab2Q9DCD2 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Xab2Q9DCD2 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Xab2Q9DCD2 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Xab2Q9DCD2 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Xab2Q9DCD2 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Xab2Q9DCD2 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Xab2Q9DCD2 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Xab2Q9DCD2 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Xab2Q9DCD2 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Xab2Q9DCD2 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Xab2Q9DCD2 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Xab2Q9DCD2 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Xab2Q9DCD2 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Xab2Q9DCD2 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Xab2Q9DCD2 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Xab2Q9DCD2 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Xab2Q9DCD2 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Xab2Q9DCD2 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Xab2Q9DCD2 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Xab2Q9DCD2 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Xab2Q9DCD2 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Xab2Q9DCD2 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Xab2Q9DCD2 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Xab2Q9DCD2 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Xab2Q9DCD2 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Xab2Q9DCD2 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Xab2Q9DCD2 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Xab2Q9DCD2 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Xab2Q9DCD2 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Xab2Q9DCD2 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Xab2Q9DCD2 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Xab2Q9DCD2 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Xab2Q9DCD2 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Xab2Q9DCD2 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Xab2Q9DCD2 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Xab2Q9DCD2 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Xab2Q9DCD2 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Xab2Q9DCD2 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Xab2Q9DCD2 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Xab2Q9DCD2 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Xab2Q9DCD2 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Xab2Q9DCD2 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Xab2Q9DCD2 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Xab2Q9DCD2 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Xab2Q9DCD2 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Xab2Q9DCD2 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Xab2Q9DCD2 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Xab2Q9DCD2 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Xab2Q9DCD2 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Xab2Q9DCD2 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Xab2Q9DCD2 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Xab2Q9DCD2 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Xab2Q9DCD2 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Xab2Q9DCD2 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Xab2Q9DCD2 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Xab2Q9DCD2 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Xab2Q9DCD2 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Xab2Q9DCD2 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Xab2Q9DCD2 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Xab2Q9DCD2 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Xab2Q9DCD2 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Xab2Q9DCD2 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Xab2Q9DCD2 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Xab2Q9DCD2 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Xab2Q9DCD2 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Xab2Q9DCD2 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Xab2Q9DCD2 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Xab2Q9DCD2 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Xab2Q9DCD2 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Xab2Q9DCD2 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Xab2Q9DCD2 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Xab2Q9DCD2 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Xab2Q9DCD2 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Xab2Q9DCD2 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Xab2Q9DCD2 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Xab2Q9DCD2 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Xab2Q9DCD2 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Xab2Q9DCD2 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Xab2Q9DCD2 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Xab2Q9DCD2 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Xab2Q9DCD2 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Xab2Q9DCD2 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Xab2Q9DCD2 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Xab2Q9DCD2 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Xab2Q9DCD2 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Xab2Q9DCD2 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Xab2Q9DCD2 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Xab2Q9DCD2 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Xab2Q9DCD2 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Xab2Q9DCD2 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Xab2Q9DCD2 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Xab2Q9DCD2 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Xab2Q9DCD2 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Xab2Q9DCD2 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Xab2Q9DCD2 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Xab2Q9DCD2 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Xab2Q9DCD2 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms