Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC33

Hmg20a, High mobility group protein 20A, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmg20aQ9DC33 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hmg20aQ9DC33 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hmg20aQ9DC33 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hmg20aQ9DC33 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Hmg20aQ9DC33 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Hmg20aQ9DC33 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Hmg20aQ9DC33 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hmg20aQ9DC33 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hmg20aQ9DC33 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hmg20aQ9DC33 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hmg20aQ9DC33 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Hmg20aQ9DC33 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hmg20aQ9DC33 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hmg20aQ9DC33 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hmg20aQ9DC33 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hmg20aQ9DC33 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hmg20aQ9DC33 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hmg20aQ9DC33 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hmg20aQ9DC33 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hmg20aQ9DC33 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hmg20aQ9DC33 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hmg20aQ9DC33 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hmg20aQ9DC33 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hmg20aQ9DC33 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hmg20aQ9DC33 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hmg20aQ9DC33 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hmg20aQ9DC33 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hmg20aQ9DC33 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hmg20aQ9DC33 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hmg20aQ9DC33 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hmg20aQ9DC33 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hmg20aQ9DC33 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hmg20aQ9DC33 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hmg20aQ9DC33 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Hmg20aQ9DC33 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hmg20aQ9DC33 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hmg20aQ9DC33 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hmg20aQ9DC33 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hmg20aQ9DC33 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hmg20aQ9DC33 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Hmg20aQ9DC33 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hmg20aQ9DC33 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hmg20aQ9DC33 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hmg20aQ9DC33 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hmg20aQ9DC33 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hmg20aQ9DC33 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hmg20aQ9DC33 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hmg20aQ9DC33 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hmg20aQ9DC33 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hmg20aQ9DC33 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hmg20aQ9DC33 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hmg20aQ9DC33 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hmg20aQ9DC33 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hmg20aQ9DC33 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hmg20aQ9DC33 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hmg20aQ9DC33 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hmg20aQ9DC33 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hmg20aQ9DC33 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hmg20aQ9DC33 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hmg20aQ9DC33 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hmg20aQ9DC33 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hmg20aQ9DC33 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Hmg20aQ9DC33 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hmg20aQ9DC33 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Hmg20aQ9DC33 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hmg20aQ9DC33 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hmg20aQ9DC33 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hmg20aQ9DC33 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hmg20aQ9DC33 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hmg20aQ9DC33 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hmg20aQ9DC33 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hmg20aQ9DC33 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Hmg20aQ9DC33 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Hmg20aQ9DC33 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hmg20aQ9DC33 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hmg20aQ9DC33 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hmg20aQ9DC33 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hmg20aQ9DC33 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hmg20aQ9DC33 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hmg20aQ9DC33 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hmg20aQ9DC33 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hmg20aQ9DC33 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hmg20aQ9DC33 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hmg20aQ9DC33 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hmg20aQ9DC33 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hmg20aQ9DC33 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hmg20aQ9DC33 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hmg20aQ9DC33 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hmg20aQ9DC33 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hmg20aQ9DC33 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hmg20aQ9DC33 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hmg20aQ9DC33 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hmg20aQ9DC33 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hmg20aQ9DC33 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hmg20aQ9DC33 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hmg20aQ9DC33 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Hmg20aQ9DC33 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
Hmg20aQ9DC33 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Hmg20aQ9DC33 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Hmg20aQ9DC33 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
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