Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU0

Tm9sf1, Transmembrane 9 superfamily member 1, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm9sf1Q9DBU0 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tm9sf1Q9DBU0 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tm9sf1Q9DBU0 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tm9sf1Q9DBU0 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tm9sf1Q9DBU0 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tm9sf1Q9DBU0 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tm9sf1Q9DBU0 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tm9sf1Q9DBU0 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tm9sf1Q9DBU0 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tm9sf1Q9DBU0 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tm9sf1Q9DBU0 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tm9sf1Q9DBU0 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tm9sf1Q9DBU0 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tm9sf1Q9DBU0 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tm9sf1Q9DBU0 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tm9sf1Q9DBU0 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tm9sf1Q9DBU0 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tm9sf1Q9DBU0 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tm9sf1Q9DBU0 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tm9sf1Q9DBU0 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Tm9sf1Q9DBU0 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tm9sf1Q9DBU0 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Tm9sf1Q9DBU0 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tm9sf1Q9DBU0 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tm9sf1Q9DBU0 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tm9sf1Q9DBU0 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tm9sf1Q9DBU0 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tm9sf1Q9DBU0 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tm9sf1Q9DBU0 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Tm9sf1Q9DBU0 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tm9sf1Q9DBU0 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tm9sf1Q9DBU0 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tm9sf1Q9DBU0 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tm9sf1Q9DBU0 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tm9sf1Q9DBU0 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tm9sf1Q9DBU0 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tm9sf1Q9DBU0 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tm9sf1Q9DBU0 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tm9sf1Q9DBU0 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tm9sf1Q9DBU0 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tm9sf1Q9DBU0 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tm9sf1Q9DBU0 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tm9sf1Q9DBU0 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tm9sf1Q9DBU0 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tm9sf1Q9DBU0 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tm9sf1Q9DBU0 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tm9sf1Q9DBU0 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tm9sf1Q9DBU0 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tm9sf1Q9DBU0 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Tm9sf1Q9DBU0 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tm9sf1Q9DBU0 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tm9sf1Q9DBU0 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Tm9sf1Q9DBU0 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tm9sf1Q9DBU0 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Tm9sf1Q9DBU0 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tm9sf1Q9DBU0 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tm9sf1Q9DBU0 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tm9sf1Q9DBU0 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tm9sf1Q9DBU0 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tm9sf1Q9DBU0 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tm9sf1Q9DBU0 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tm9sf1Q9DBU0 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tm9sf1Q9DBU0 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tm9sf1Q9DBU0 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tm9sf1Q9DBU0 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tm9sf1Q9DBU0 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tm9sf1Q9DBU0 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tm9sf1Q9DBU0 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tm9sf1Q9DBU0 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tm9sf1Q9DBU0 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tm9sf1Q9DBU0 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tm9sf1Q9DBU0 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tm9sf1Q9DBU0 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tm9sf1Q9DBU0 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tm9sf1Q9DBU0 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tm9sf1Q9DBU0 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Tm9sf1Q9DBU0 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tm9sf1Q9DBU0 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tm9sf1Q9DBU0 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tm9sf1Q9DBU0 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tm9sf1Q9DBU0 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tm9sf1Q9DBU0 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tm9sf1Q9DBU0 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tm9sf1Q9DBU0 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tm9sf1Q9DBU0 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tm9sf1Q9DBU0 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tm9sf1Q9DBU0 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tm9sf1Q9DBU0 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Tm9sf1Q9DBU0 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Tm9sf1Q9DBU0 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tm9sf1Q9DBU0 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tm9sf1Q9DBU0 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Tm9sf1Q9DBU0 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Tm9sf1Q9DBU0 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tm9sf1Q9DBU0 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tm9sf1Q9DBU0 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tm9sf1Q9DBU0 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tm9sf1Q9DBU0 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tm9sf1Q9DBU0 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tm9sf1Q9DBU0 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms