Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc97Q9DBT3 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc97Q9DBT3 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc97Q9DBT3 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc97Q9DBT3 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc97Q9DBT3 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc97Q9DBT3 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc97Q9DBT3 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc97Q9DBT3 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc97Q9DBT3 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc97Q9DBT3 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc97Q9DBT3 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ccdc97Q9DBT3 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ccdc97Q9DBT3 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ccdc97Q9DBT3 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ccdc97Q9DBT3 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc97Q9DBT3 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc97Q9DBT3 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc97Q9DBT3 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc97Q9DBT3 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc97Q9DBT3 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc97Q9DBT3 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc97Q9DBT3 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc97Q9DBT3 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc97Q9DBT3 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc97Q9DBT3 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc97Q9DBT3 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc97Q9DBT3 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc97Q9DBT3 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc97Q9DBT3 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc97Q9DBT3 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc97Q9DBT3 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc97Q9DBT3 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc97Q9DBT3 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc97Q9DBT3 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc97Q9DBT3 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc97Q9DBT3 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc97Q9DBT3 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc97Q9DBT3 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc97Q9DBT3 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc97Q9DBT3 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc97Q9DBT3 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc97Q9DBT3 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc97Q9DBT3 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc97Q9DBT3 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc97Q9DBT3 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc97Q9DBT3 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc97Q9DBT3 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc97Q9DBT3 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc97Q9DBT3 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc97Q9DBT3 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc97Q9DBT3 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc97Q9DBT3 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc97Q9DBT3 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc97Q9DBT3 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc97Q9DBT3 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc97Q9DBT3 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc97Q9DBT3 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc97Q9DBT3 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc97Q9DBT3 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc97Q9DBT3 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc97Q9DBT3 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc97Q9DBT3 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc97Q9DBT3 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc97Q9DBT3 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc97Q9DBT3 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc97Q9DBT3 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc97Q9DBT3 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc97Q9DBT3 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc97Q9DBT3 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc97Q9DBT3 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc97Q9DBT3 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc97Q9DBT3 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc97Q9DBT3 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc97Q9DBT3 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc97Q9DBT3 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc97Q9DBT3 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc97Q9DBT3 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc97Q9DBT3 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc97Q9DBT3 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc97Q9DBT3 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc97Q9DBT3 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc97Q9DBT3 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc97Q9DBT3 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc97Q9DBT3 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc97Q9DBT3 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc97Q9DBT3 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc97Q9DBT3 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc97Q9DBT3 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc97Q9DBT3 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc97Q9DBT3 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc97Q9DBT3 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc97Q9DBT3 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc97Q9DBT3 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc97Q9DBT3 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc97Q9DBT3 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc97Q9DBT3 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc97Q9DBT3 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc97Q9DBT3 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc97Q9DBT3 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
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