Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA80

Rsph3b, Radial spoke head protein 3 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph3bQ9DA80 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rsph3bQ9DA80 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rsph3bQ9DA80 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rsph3bQ9DA80 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rsph3bQ9DA80 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rsph3bQ9DA80 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rsph3bQ9DA80 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rsph3bQ9DA80 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rsph3bQ9DA80 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rsph3bQ9DA80 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rsph3bQ9DA80 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rsph3bQ9DA80 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rsph3bQ9DA80 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rsph3bQ9DA80 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rsph3bQ9DA80 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rsph3bQ9DA80 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rsph3bQ9DA80 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rsph3bQ9DA80 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rsph3bQ9DA80 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rsph3bQ9DA80 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rsph3bQ9DA80 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rsph3bQ9DA80 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rsph3bQ9DA80 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rsph3bQ9DA80 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rsph3bQ9DA80 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rsph3bQ9DA80 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rsph3bQ9DA80 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rsph3bQ9DA80 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rsph3bQ9DA80 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rsph3bQ9DA80 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rsph3bQ9DA80 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rsph3bQ9DA80 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rsph3bQ9DA80 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rsph3bQ9DA80 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rsph3bQ9DA80 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rsph3bQ9DA80 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rsph3bQ9DA80 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rsph3bQ9DA80 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rsph3bQ9DA80 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rsph3bQ9DA80 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rsph3bQ9DA80 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rsph3bQ9DA80 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rsph3bQ9DA80 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rsph3bQ9DA80 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rsph3bQ9DA80 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rsph3bQ9DA80 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rsph3bQ9DA80 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rsph3bQ9DA80 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rsph3bQ9DA80 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rsph3bQ9DA80 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rsph3bQ9DA80 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rsph3bQ9DA80 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rsph3bQ9DA80 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rsph3bQ9DA80 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rsph3bQ9DA80 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rsph3bQ9DA80 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rsph3bQ9DA80 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rsph3bQ9DA80 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rsph3bQ9DA80 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rsph3bQ9DA80 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rsph3bQ9DA80 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rsph3bQ9DA80 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rsph3bQ9DA80 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rsph3bQ9DA80 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rsph3bQ9DA80 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rsph3bQ9DA80 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rsph3bQ9DA80 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rsph3bQ9DA80 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rsph3bQ9DA80 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rsph3bQ9DA80 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rsph3bQ9DA80 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rsph3bQ9DA80 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rsph3bQ9DA80 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rsph3bQ9DA80 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rsph3bQ9DA80 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rsph3bQ9DA80 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rsph3bQ9DA80 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rsph3bQ9DA80 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rsph3bQ9DA80 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rsph3bQ9DA80 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rsph3bQ9DA80 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rsph3bQ9DA80 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rsph3bQ9DA80 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rsph3bQ9DA80 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rsph3bQ9DA80 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rsph3bQ9DA80 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rsph3bQ9DA80 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rsph3bQ9DA80 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rsph3bQ9DA80 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rsph3bQ9DA80 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rsph3bQ9DA80 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rsph3bQ9DA80 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rsph3bQ9DA80 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rsph3bQ9DA80 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rsph3bQ9DA80 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rsph3bQ9DA80 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rsph3bQ9DA80 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rsph3bQ9DA80 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rsph3bQ9DA80 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rsph3bQ9DA80 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms