Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M4

Pdzd9, PDZ domain-containing protein 9, mousemouse

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Length 266 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd9Q9D9M4 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pdzd9Q9D9M4 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pdzd9Q9D9M4 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pdzd9Q9D9M4 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pdzd9Q9D9M4 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pdzd9Q9D9M4 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pdzd9Q9D9M4 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Pdzd9Q9D9M4 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Pdzd9Q9D9M4 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pdzd9Q9D9M4 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pdzd9Q9D9M4 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Pdzd9Q9D9M4 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Pdzd9Q9D9M4 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pdzd9Q9D9M4 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Pdzd9Q9D9M4 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pdzd9Q9D9M4 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pdzd9Q9D9M4 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pdzd9Q9D9M4 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pdzd9Q9D9M4 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pdzd9Q9D9M4 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pdzd9Q9D9M4 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Pdzd9Q9D9M4 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pdzd9Q9D9M4 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pdzd9Q9D9M4 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pdzd9Q9D9M4 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pdzd9Q9D9M4 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pdzd9Q9D9M4 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pdzd9Q9D9M4 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pdzd9Q9D9M4 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pdzd9Q9D9M4 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pdzd9Q9D9M4 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pdzd9Q9D9M4 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pdzd9Q9D9M4 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pdzd9Q9D9M4 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pdzd9Q9D9M4 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pdzd9Q9D9M4 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pdzd9Q9D9M4 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pdzd9Q9D9M4 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pdzd9Q9D9M4 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pdzd9Q9D9M4 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pdzd9Q9D9M4 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pdzd9Q9D9M4 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pdzd9Q9D9M4 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pdzd9Q9D9M4 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pdzd9Q9D9M4 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pdzd9Q9D9M4 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pdzd9Q9D9M4 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Pdzd9Q9D9M4 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pdzd9Q9D9M4 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pdzd9Q9D9M4 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pdzd9Q9D9M4 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Pdzd9Q9D9M4 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pdzd9Q9D9M4 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pdzd9Q9D9M4 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pdzd9Q9D9M4 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pdzd9Q9D9M4 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pdzd9Q9D9M4 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pdzd9Q9D9M4 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pdzd9Q9D9M4 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pdzd9Q9D9M4 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pdzd9Q9D9M4 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pdzd9Q9D9M4 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pdzd9Q9D9M4 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pdzd9Q9D9M4 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pdzd9Q9D9M4 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pdzd9Q9D9M4 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pdzd9Q9D9M4 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
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Pdzd9Q9D9M4 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pdzd9Q9D9M4 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pdzd9Q9D9M4 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pdzd9Q9D9M4 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pdzd9Q9D9M4 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pdzd9Q9D9M4 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pdzd9Q9D9M4 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pdzd9Q9D9M4 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pdzd9Q9D9M4 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pdzd9Q9D9M4 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pdzd9Q9D9M4 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pdzd9Q9D9M4 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pdzd9Q9D9M4 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pdzd9Q9D9M4 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pdzd9Q9D9M4 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pdzd9Q9D9M4 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pdzd9Q9D9M4 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pdzd9Q9D9M4 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pdzd9Q9D9M4 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pdzd9Q9D9M4 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pdzd9Q9D9M4 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pdzd9Q9D9M4 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pdzd9Q9D9M4 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pdzd9Q9D9M4 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Pdzd9Q9D9M4 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pdzd9Q9D9M4 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Pdzd9Q9D9M4 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Pdzd9Q9D9M4 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Pdzd9Q9D9M4 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Pdzd9Q9D9M4 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Pdzd9Q9D9M4 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pdzd9Q9D9M4 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
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