Protein–RNA interactions for Protein: Q9D906

Atg7, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme ATG7, mousemouse

Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg7Q9D906 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg7Q9D906 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg7Q9D906 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg7Q9D906 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg7Q9D906 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg7Q9D906 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg7Q9D906 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg7Q9D906 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg7Q9D906 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg7Q9D906 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg7Q9D906 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg7Q9D906 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg7Q9D906 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg7Q9D906 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg7Q9D906 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg7Q9D906 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg7Q9D906 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg7Q9D906 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg7Q9D906 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg7Q9D906 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg7Q9D906 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg7Q9D906 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg7Q9D906 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg7Q9D906 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg7Q9D906 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg7Q9D906 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg7Q9D906 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg7Q9D906 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg7Q9D906 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg7Q9D906 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg7Q9D906 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg7Q9D906 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg7Q9D906 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg7Q9D906 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg7Q9D906 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg7Q9D906 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg7Q9D906 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg7Q9D906 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg7Q9D906 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg7Q9D906 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg7Q9D906 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg7Q9D906 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg7Q9D906 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg7Q9D906 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg7Q9D906 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg7Q9D906 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg7Q9D906 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg7Q9D906 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg7Q9D906 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg7Q9D906 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg7Q9D906 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg7Q9D906 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg7Q9D906 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg7Q9D906 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg7Q9D906 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg7Q9D906 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg7Q9D906 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg7Q9D906 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg7Q9D906 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg7Q9D906 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg7Q9D906 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg7Q9D906 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg7Q9D906 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg7Q9D906 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg7Q9D906 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg7Q9D906 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg7Q9D906 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg7Q9D906 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg7Q9D906 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg7Q9D906 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg7Q9D906 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg7Q9D906 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg7Q9D906 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg7Q9D906 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg7Q9D906 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg7Q9D906 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg7Q9D906 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg7Q9D906 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg7Q9D906 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg7Q9D906 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg7Q9D906 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg7Q9D906 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg7Q9D906 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg7Q9D906 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg7Q9D906 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg7Q9D906 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg7Q9D906 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg7Q9D906 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg7Q9D906 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg7Q9D906 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg7Q9D906 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg7Q9D906 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg7Q9D906 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg7Q9D906 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg7Q9D906 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg7Q9D906 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg7Q9D906 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg7Q9D906 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg7Q9D906 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg7Q9D906 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.4 ms