Protein–RNA interactions for Protein: Q9D824

Fip1l1, Pre-mRNA 3'-end-processing factor FIP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fip1l1Q9D824 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Fip1l1Q9D824 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Fip1l1Q9D824 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Fip1l1Q9D824 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Fip1l1Q9D824 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Fip1l1Q9D824 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Fip1l1Q9D824 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Fip1l1Q9D824 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Fip1l1Q9D824 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Fip1l1Q9D824 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC14.21□□□□□ -0.14
Fip1l1Q9D824 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Fip1l1Q9D824 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Fip1l1Q9D824 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Fip1l1Q9D824 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Fip1l1Q9D824 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Fip1l1Q9D824 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Fip1l1Q9D824 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Fip1l1Q9D824 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Fip1l1Q9D824 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Fip1l1Q9D824 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Fip1l1Q9D824 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Fip1l1Q9D824 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Fip1l1Q9D824 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Fip1l1Q9D824 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Fip1l1Q9D824 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Fip1l1Q9D824 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Fip1l1Q9D824 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Fip1l1Q9D824 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Fip1l1Q9D824 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Fip1l1Q9D824 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Fip1l1Q9D824 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Fip1l1Q9D824 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Fip1l1Q9D824 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Fip1l1Q9D824 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Fip1l1Q9D824 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Fip1l1Q9D824 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Fip1l1Q9D824 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Fip1l1Q9D824 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Fip1l1Q9D824 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Fip1l1Q9D824 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Fip1l1Q9D824 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Fip1l1Q9D824 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Fip1l1Q9D824 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Fip1l1Q9D824 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Fip1l1Q9D824 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Fip1l1Q9D824 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Fip1l1Q9D824 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Fip1l1Q9D824 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Fip1l1Q9D824 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Fip1l1Q9D824 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Fip1l1Q9D824 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Fip1l1Q9D824 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Fip1l1Q9D824 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Fip1l1Q9D824 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Fip1l1Q9D824 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Fip1l1Q9D824 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Fip1l1Q9D824 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Fip1l1Q9D824 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Fip1l1Q9D824 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Fip1l1Q9D824 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Fip1l1Q9D824 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Fip1l1Q9D824 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Fip1l1Q9D824 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Fip1l1Q9D824 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Fip1l1Q9D824 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Fip1l1Q9D824 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Fip1l1Q9D824 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Fip1l1Q9D824 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Fip1l1Q9D824 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Fip1l1Q9D824 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Fip1l1Q9D824 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Fip1l1Q9D824 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Fip1l1Q9D824 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Fip1l1Q9D824 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Fip1l1Q9D824 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Fip1l1Q9D824 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Fip1l1Q9D824 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Fip1l1Q9D824 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Fip1l1Q9D824 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Fip1l1Q9D824 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Fip1l1Q9D824 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Fip1l1Q9D824 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Fip1l1Q9D824 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Fip1l1Q9D824 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Fip1l1Q9D824 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Fip1l1Q9D824 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Fip1l1Q9D824 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Fip1l1Q9D824 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Fip1l1Q9D824 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Fip1l1Q9D824 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Fip1l1Q9D824 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Fip1l1Q9D824 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Fip1l1Q9D824 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Fip1l1Q9D824 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Fip1l1Q9D824 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Fip1l1Q9D824 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Fip1l1Q9D824 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Fip1l1Q9D824 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Fip1l1Q9D824 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Fip1l1Q9D824 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms