Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7D7

Cldn23, Claudin-23, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn23Q9D7D7 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC12.33□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Cldn23Q9D7D7 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn23Q9D7D7 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn23Q9D7D7 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn23Q9D7D7 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn23Q9D7D7 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn23Q9D7D7 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn23Q9D7D7 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn23Q9D7D7 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn23Q9D7D7 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn23Q9D7D7 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn23Q9D7D7 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn23Q9D7D7 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn23Q9D7D7 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn23Q9D7D7 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn23Q9D7D7 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
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