Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6T1

Tube1, Tubulin epsilon chain, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tube1Q9D6T1 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tube1Q9D6T1 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tube1Q9D6T1 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tube1Q9D6T1 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tube1Q9D6T1 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tube1Q9D6T1 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tube1Q9D6T1 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tube1Q9D6T1 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tube1Q9D6T1 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tube1Q9D6T1 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tube1Q9D6T1 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tube1Q9D6T1 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tube1Q9D6T1 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tube1Q9D6T1 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tube1Q9D6T1 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tube1Q9D6T1 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tube1Q9D6T1 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tube1Q9D6T1 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tube1Q9D6T1 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tube1Q9D6T1 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tube1Q9D6T1 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tube1Q9D6T1 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tube1Q9D6T1 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tube1Q9D6T1 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tube1Q9D6T1 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tube1Q9D6T1 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tube1Q9D6T1 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tube1Q9D6T1 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Tube1Q9D6T1 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tube1Q9D6T1 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tube1Q9D6T1 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tube1Q9D6T1 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tube1Q9D6T1 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tube1Q9D6T1 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tube1Q9D6T1 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tube1Q9D6T1 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tube1Q9D6T1 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tube1Q9D6T1 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tube1Q9D6T1 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tube1Q9D6T1 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tube1Q9D6T1 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tube1Q9D6T1 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Tube1Q9D6T1 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tube1Q9D6T1 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tube1Q9D6T1 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tube1Q9D6T1 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tube1Q9D6T1 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tube1Q9D6T1 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tube1Q9D6T1 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tube1Q9D6T1 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tube1Q9D6T1 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tube1Q9D6T1 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tube1Q9D6T1 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tube1Q9D6T1 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tube1Q9D6T1 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tube1Q9D6T1 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tube1Q9D6T1 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tube1Q9D6T1 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Tube1Q9D6T1 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Tube1Q9D6T1 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Tube1Q9D6T1 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tube1Q9D6T1 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tube1Q9D6T1 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tube1Q9D6T1 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tube1Q9D6T1 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tube1Q9D6T1 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tube1Q9D6T1 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tube1Q9D6T1 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tube1Q9D6T1 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tube1Q9D6T1 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tube1Q9D6T1 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tube1Q9D6T1 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tube1Q9D6T1 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tube1Q9D6T1 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tube1Q9D6T1 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tube1Q9D6T1 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tube1Q9D6T1 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tube1Q9D6T1 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tube1Q9D6T1 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tube1Q9D6T1 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tube1Q9D6T1 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tube1Q9D6T1 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tube1Q9D6T1 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Tube1Q9D6T1 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Tube1Q9D6T1 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Tube1Q9D6T1 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Tube1Q9D6T1 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tube1Q9D6T1 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Tube1Q9D6T1 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Tube1Q9D6T1 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Tube1Q9D6T1 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tube1Q9D6T1 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Tube1Q9D6T1 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tube1Q9D6T1 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tube1Q9D6T1 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tube1Q9D6T1 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tube1Q9D6T1 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tube1Q9D6T1 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tube1Q9D6T1 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tube1Q9D6T1 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms