Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6G9

Cmtm5, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm5Q9D6G9 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cmtm5Q9D6G9 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cmtm5Q9D6G9 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cmtm5Q9D6G9 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cmtm5Q9D6G9 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cmtm5Q9D6G9 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cmtm5Q9D6G9 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cmtm5Q9D6G9 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cmtm5Q9D6G9 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cmtm5Q9D6G9 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cmtm5Q9D6G9 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cmtm5Q9D6G9 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cmtm5Q9D6G9 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cmtm5Q9D6G9 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cmtm5Q9D6G9 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cmtm5Q9D6G9 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cmtm5Q9D6G9 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cmtm5Q9D6G9 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cmtm5Q9D6G9 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cmtm5Q9D6G9 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cmtm5Q9D6G9 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cmtm5Q9D6G9 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cmtm5Q9D6G9 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cmtm5Q9D6G9 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cmtm5Q9D6G9 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cmtm5Q9D6G9 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cmtm5Q9D6G9 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cmtm5Q9D6G9 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cmtm5Q9D6G9 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cmtm5Q9D6G9 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cmtm5Q9D6G9 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cmtm5Q9D6G9 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cmtm5Q9D6G9 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cmtm5Q9D6G9 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cmtm5Q9D6G9 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cmtm5Q9D6G9 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cmtm5Q9D6G9 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cmtm5Q9D6G9 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cmtm5Q9D6G9 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cmtm5Q9D6G9 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cmtm5Q9D6G9 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cmtm5Q9D6G9 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cmtm5Q9D6G9 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cmtm5Q9D6G9 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cmtm5Q9D6G9 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cmtm5Q9D6G9 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cmtm5Q9D6G9 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cmtm5Q9D6G9 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cmtm5Q9D6G9 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cmtm5Q9D6G9 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cmtm5Q9D6G9 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cmtm5Q9D6G9 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cmtm5Q9D6G9 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cmtm5Q9D6G9 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cmtm5Q9D6G9 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cmtm5Q9D6G9 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cmtm5Q9D6G9 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cmtm5Q9D6G9 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cmtm5Q9D6G9 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cmtm5Q9D6G9 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cmtm5Q9D6G9 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cmtm5Q9D6G9 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cmtm5Q9D6G9 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cmtm5Q9D6G9 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cmtm5Q9D6G9 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cmtm5Q9D6G9 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cmtm5Q9D6G9 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cmtm5Q9D6G9 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cmtm5Q9D6G9 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cmtm5Q9D6G9 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cmtm5Q9D6G9 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cmtm5Q9D6G9 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cmtm5Q9D6G9 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cmtm5Q9D6G9 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cmtm5Q9D6G9 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cmtm5Q9D6G9 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cmtm5Q9D6G9 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cmtm5Q9D6G9 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cmtm5Q9D6G9 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cmtm5Q9D6G9 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cmtm5Q9D6G9 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cmtm5Q9D6G9 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cmtm5Q9D6G9 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cmtm5Q9D6G9 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cmtm5Q9D6G9 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cmtm5Q9D6G9 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cmtm5Q9D6G9 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cmtm5Q9D6G9 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cmtm5Q9D6G9 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cmtm5Q9D6G9 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cmtm5Q9D6G9 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cmtm5Q9D6G9 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cmtm5Q9D6G9 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Cmtm5Q9D6G9 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cmtm5Q9D6G9 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cmtm5Q9D6G9 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Cmtm5Q9D6G9 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cmtm5Q9D6G9 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cmtm5Q9D6G9 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cmtm5Q9D6G9 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms